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Dehouck-Gilis-Rooman统计势能函数的简化.pdf
第11卷第1期 生物信息学 V01.11No.1
201 Chinese ofBioinfcIrmatics Mar.,2013
3年3月 Journal
doi:10.3969/j.issn.1672—5565.2013.01.04
Dehouck..Gilis..Rooman
统计势能函数的简化
陆文伟1,-,黄日波2…,杜丽琴3,韦宇拓3
(1.广西大学数学与信息科学学院,广西南宁530004;2.广西科学院,广西南宁530007
3.广西大学生命科学与技术学院,广西南宁530004)
effective
摘 要:统计有效能函数(Statisticalenergy
出了一种新型的统计势能函数,这种势能函数由有限个可加和的项组成。我们试图对这种势能函数进行简化,即通过诱导蛋
白质数据库选择尽可能少的势能项,而且这些势能项的加和可满足一定的性能要求。结果我们得出了六组势能项组合,其性
能可和DGR小组得出的势能项组合相媲美,但其势能项数目却大大减少,完全可用于蛋白质结构预测。
关键词:诱导蛋白数据集,能量函数性能,蛋白质结构预测,统计有效能函数,富集
中图分类号:Q518.2文献标识码:A 文章编号:1672—5565(2013)一01—022—07
Reduced ofDehouck.Gilis-Rooman
representation
function datasets
potential byselectingagainstdecoy
LU Yu—tu03
Wen—weil’2,HUANGRi—b02’3,DULi—qin3,WEI
and Mathematicsand 530004China
(1.ScienceTechnologyof lmformationSciences,GnangxiUniversity,NanningGnangxi
College
Scienceand
2.GuangxiAcademyofSciences,NanningGuangxi530007,China;3.College旷LifeBiotechnology,
530004,China)
GaangxiUniversity,NanningGuangxi
statistical ofthedatabaseof
effective derivedfromthe
Abstract:Statisticalfunction(SEEF)is
energy analysis
known has createdanew ofSEEFin
recently generation
proteinstructures.Dehouck-Gilis—Room
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