花生开花时间的全基因组关联分析及候选基因筛选.pdfVIP

作物学报ACTAAGRONOMICASINICA2025,51(5):14001408/

ISSN0496-3490;CN11-1809/S;CODENTSHPA9E-mail:zwxb301@

DOI:10.3724/SP.J.1006.2025.44145

花生开花时间的全基因组关联分析及候选基因筛选

李文佳1,2廖泳俊2黄璐2鲁清2李少雄2陈小平2金晶炜1,*

王润风2,*

1西北农林科技大学草业与草原学院,陕西杨凌712100;2广东省农业科学院作物研究所/广东省农作物遗传改良重点实验室/国

家油料作物改良中心南方花生分中心,广东广州510640

摘要:开花时间是评价花生早熟品种的重要指标之一,对产量亦有重要影响。挖掘花生开花时间相关遗传位点并

筛选候选基因,对于花生早熟育种至关重要。本文以390份花生栽培种自然群体为材料,统计了在5种环境下的开花

时间。表型统计结果显示,5种环境下,花生开花时间的变异系数介于3.21%~8.54%之间,存在较丰富的表型变异。

花生的开花时间基本呈现正态分布,且受环境影响较大。通过全基因组关联分析,共得到259个与开花时间显著关联

的SNP位点,其中有29个位点在2个以上环境中重复出现,分别位于A01、A02、A03、A04、A05、A07、A10、

B01、B02、B03、B04、B06、B07、B09染色体上,可解释3.47%~8.58%的表型变异。在29个重复出现位点上下游

100kb的置信区间寻找候选基因,共发现159个有功能注释的基因。在重复检测的位点的候选区间中预测到7个与

花生开花时间相关的候选基因,分别编码R2R3-MYB转录因子、叶绿素a-b结合蛋白、bHLH转录因子、WRKY转

录因子、FAR1转录因子。研究结果可为解析花生开花调控遗传机制及花生早熟育种奠定基础。

关键词:花生;开花时间;全基因组关联分析;候选基因;早熟育种

Genome-wideassociateanalysisoffloweringtraitsandidentificationofcandi-

dategenesinpeanut

1,222222

LIWen-Jia,LIAOYong-Jun,HUANGLu,LUQing,LIShao-Xiong,CHENXiao-Ping,JIN

Jing-Wei1,*,andWANGRun-Feng2,*

1CollegeofGrasslandAgriculture,NorthwestAFUniversity,Yangling712100,Shaanxi,China;2CropsResearchInstitute,GuangdongAcademyof

AgriculturalSciences/GuangdongProvincialKeyLaboratoryofCropGeneticImprov