耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌全基因组测序及黏菌素耐药分析.docxVIP

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中国感染控制杂志2025年1月第24卷第1期ChinJInfectControlVol24No1Jan2025·37·

DOI:10.12138/j.issn.1671-9638.·论著·

耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌全基因组测序及黏菌素耐药分析

储雯雯,刘周,李昕,叶乃芳,龚真,曾晓娇,周强(安徽医科大学第二附属医院检验科,安徽合肥230601)

[摘要]目的通过全基因组测序分析临床耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学及黏菌素耐药基因,为临床诊疗提供参考。方法收集2021—2023年安徽省某三级甲等综合医院住院患者临床标本分离的57株CRKP,对所有菌株进行药敏试验。采用全基因测序技术分析CRKP菌株多位点序列分型、荚膜血清型、耐药基因和毒力基因,并对所有菌株序列进行单核苷酸多态性分析,采用聚合酶链式反应(PCR)方法扩增与黏菌素耐药相关基因。结果57株CRKP对除替加环素外的14种抗菌药物均为耐药。测序结果显示,93.0%(53/57)的CRKP携带blaKPC-2,ST11型CRKP菌株检出率最高(51/57,89.5%)。单核苷酸多态性聚类分析表明,57株CRKP分为11个克隆群,其中有4个克隆群均为ST11-KL64型CRKP。40株(70.2%)CRKP携带多种毒力基因。

5株黏菌素耐药CRKP,其耐药机制是在mgrB基因70位点处插入一个ISKpn26元件。结论CRKP菌株以产KPC-2ST11-KL64型为主要流行型,在重症监护病房有播散性流行。ISKpn26元件插入引起mgrB基因突变与该地区CRKP黏菌素耐药有关。

[关键词]耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌;全基因组测序;单核苷酸多态性分析;黏菌素;耐药;ISKpn26

[中图分类号]R181.3+2R378.99+6

whole-genomesequencingandcolistinresistanceofcarbapenem-resistant

klebsiellapneumoniae

CHUWen∞en,LIUZhou,LIXin,YENaifang,GONGZhen,ZENGXiaojiao,ZHOUQiang(DepartmentofLaboratoryMedicine,ThesecondHospitalofAnhuiMedicalUniyersi-ty,Hefei230601,China)

[Abstract]ObjectiveToanalyzethemolecularepidemiologyandcolistin-resistantgenesofcarbapenem-resistantklebsiellapneumoniae(CRKP)bywhole-genomesequencing,andtoprovidereferenceforclinicaldiagnosisandtreatment.Methods57CRKPstrainsisolatedfromclinicalspecimensofhospitalizedpatientsinatertiarygeneralfirst-classhospitalinAnhuiProvincefrom2021to2023werecollectedandantimicrobialsusceptibilitytestingwasperformed.Multilocussequencetyping,capsuleserotype,resistancegenes,andvirulencegenesofCRKPstrainswereanalyzedb

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