基于转录组数据急性心肌梗死双硫死亡相关预测模型的构建.docxVIP

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2025-09-05 发布于江苏
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基于转录组数据急性心肌梗死双硫死亡相关预测模型的构建.docx

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中国医学科学院学报

ACTAACADEMIAEMEDICINAESINICAE

354June92025

●论著●

基于转录组数据急性心肌梗死双硫死亡相关预测模型的构建

唐秋绒,冯旸,赵耀,边云飞

山西医科大学第二医院心内科,太原030000

通信作者:边云飞电话:,电子邮件:sYdeYYunfeibian@163.com

摘要:目的应用生物信息学方法筛选急性心肌梗死(AMI)中差异双硫死亡相关基因(DRG),分析DRG在AMI中的分子模式并构建DRG相关预测模型。方法从基因表达综合数据库下载AMI相关数据集,筛选AMI中差异表达DRG。采用CIBERSORT法分析免疫浸润情况。基于差异表达DRG对AMI患者进行一致性聚类分析并分型,基于分型结果进行免疫浸润分析、差异分析、基因本体、京都基因与基因组百科全书和基因集变异分析;随后进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),构建亚型相关模块并筛选枢纽基因,最后基于枢纽基因构建最小绝对收缩和选择算子、随机森林和支持向量机递归特征消除模型筛选核心基因,构建DRG相关预测模型。通过绘制列线图和受试者工作特征曲线(ROC)评估预测模型的诊断效能,并进行外部验证。结果从AMI患者和对照者间筛选出9个差异表达DRG,根据其表达水平将AMI患者分为C1和C2两个亚型。单核细胞、M0型巨噬细胞和中性粒细胞在AMI患者及C1亚型中浸润增多(P均0.05),DRG与免疫细胞密切相关。DRG的C1和C2亚型间共鉴定出257个基因差异表达,且与骨髓白细胞活化和细胞因子的正向调节等生物过程相关,C1亚型中Fc丫受体介导的吞噬作用和NOD样受体信号通路活性增强。WGCNA分析显示棕色模块与DRG亚型最相关(r=0.67),从该模块中筛选出23个差异表达枢纽基因。3种机器学习方法筛选的特征基因取交集得到AQP9、F5和PYGL基因构成的DRG相关预测模型。列线图和ROC曲线(AUC训练集=0.891,AUC验证集=0.840)均显示出良好的临床诊断效能。结论DRG与AMI发生发展密切相关,DRG相关预测模型(AQP9、F5和PYGL)可能为AMI的诊断和个性化治疗提供潜在靶点。

关键词:急性心肌梗死;双硫死亡;一致性聚类;免疫浸润;生物信息学

中图分类号:R541.4文献标识码:A文章编号:1000-503X(2025)03-354-12

DOI:10.3881/j.issn.1000-503X.16057

ConstructionofaDisulfidptosis-RelatedpredictionModelforAcuteMyocardial

InfarctionBasedonTranscriptomeData

TANGQiurong,FENGYang,ZHAOYao,BIANYunfei

DepartmentofCardiologY,SecondHospitalofShanxiMedicalUniversitY,TaiYuan030000,China

Correspondingauthor:BIANYunfeiTel:,E-mail:sYdeYYunfeibian@163.com

ABSTRACT:ObjectiveToidentifYdisulfidptosis-relatedgene(DRG)inacutemYocardialinfarction(AMI)bYbioinformatics,analYzethemolecularpatternofDRGsinAMI,andconstructaDRGs-relatedpredic- tionmodel.MethodsAMI-relateddatasetsweredownloadedfromtheGeneExpressionOmnibusdatabase,andDRGswithdi