蛋白质化学课件.pptVIP

二、構型與構象構型(configuration)：分D或L型構象(conformation)：單鍵的旋轉維繫蛋白質三維結構的作用力有：氫鍵、疏水力、離子鍵、範德華力、配位鍵、酯鍵、二硫鍵等。a.鹽鍵b.氫鍵c.疏水鍵d.範得華力e.二硫鍵維持蛋白質分子構象的作用力指多肽鏈主鏈由於氫鍵的作用而形成的空間排布。它只涉及肽鏈主鏈的構象及鏈內或鏈間形成的氫鍵。主要有?-螺旋、?-折疊、?-轉角、γ-轉角、無規則捲曲等。三、蛋白質的二級結構Secondarystructure1.多肽鏈主鏈環繞螺旋中心軸螺旋式上升。螺旋一周，沿軸上升的距離即螺距為0.54nm，含3.6個氨基酸殘基；兩個氨基酸之間的距離為0.15nm。⑴?-螺旋(?-helix)1951年，PaulingandCorey提出，要點有：2.肽鏈內形成氫鍵，氫鍵的取向幾乎與軸平行，第一個氨基酸殘基的醯胺基團的-CO基與其後第四個氨基酸殘基醯胺基團的-NH基形成氫鍵；3.多肽鏈上有脯氨酸，螺旋就中斷；4.蛋白質分子為右手?-螺旋。?-折疊是由兩條或多條几乎完全伸展的肽鏈平行排列，通過鏈間的氫鍵交聯而形成的。肽鏈的主鏈呈鋸齒樁折疊構象。?-折疊有兩種類型：平行式和反平行式。(2)β-折疊(β-pleatedsheet)反平行式?-折疊平行式?-折疊由四個氨基酸殘基組成，彎曲處的第一個氨基酸殘基的-C=O和第四個殘基的–NH之間形成氫鍵，形成一個不很穩定的環狀結構。(3)β-轉角(β-turn)四、蛋白質的超二級結構Supersecondarystructure指相互鄰近的二級結構在空間折疊中靠近，彼此相互作用，形成規則的二級結構聚合體。種類有：αα、βαβ、βββ等。五、蛋白質的結構域structuraldomain在較大的蛋白質分子或亞基中，其三維結構往往可以形成兩個或多個空間上可以明顯區別的區域。肌鈣蛋白C是指在二級結構基礎上，肽鏈進一步折疊捲曲形成的特定空間構象。包括側鏈基團在內的所有原子空間排列。維繫蛋白質三級結構的主要作用力是次級鍵。包括氫鍵、疏水鍵、離子鍵和範德華力等。六、蛋白質的三級結構Tertiarystructure蛋白質化學蛋白質是一類含氮有機化合物，除含有碳、氫、氧、氮和少量的硫外，某些蛋白質還含有磷、鐵、鋅、銅、鉬、碘等元素。碳50～55％氫6～8％氧20～23％氮15～18%硫0～4％第一節蛋白質的分子組成由於大多數蛋白質的含氮量接近於16%，所以，可以根據生物樣品中的含氮量來計算蛋白質的大概含量：樣品蛋白質含量=樣品含氮量?6.25蛋白質水解降解物蛋白質眎腖多肽二肽氨基酸分子品質(u)＞1075×1052×103500～1000約200約100隨著水解條件的改變，肽以前的這些降解物最終都可以水解成氨基酸；而氨基酸則不能水解成更小的單位。所以，氨基酸是蛋白質的基本結構單元。組成生物體蛋白質的氨基酸常見的有20種。通式為：R—CH—NH2COOH其中19種為α氨基酸，脯氨酸為亞氨基酸。除甘氨酸外，蛋白質水解得到的氨基酸都屬於L構型。氨基酸的分類根據R基團的極性分類：1.非極性氨基酸：Ala、Val、Leu、Ile、Phe、Met、Pro、Trp2.極性不帶電荷氨基酸：Gly、Ser、Thr、Asn、Gln、Tyr、Cys3.極性帶負電荷氨基酸：Asp、Glu4.極性帶正電荷氨基酸：His、Lys、Arg非極性氨基酸極性不帶電荷氨基酸極性帶負電荷氨基酸極性帶正電荷氨基酸硒代半胱氨酸（Selenocysteine）isfoundinmanyenzymes(havingbeenrecognizedasthe21staminoacidinribosome-mediatedproteinsynthesis!).根據R基團的結構分類：脂肪族氨基酸：Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Met、Cys、Ser、Thr、Glu、Asp、Lys、Arg、Gln、Asn芳香族氨基酸：Phe、Tyr雜環氨基酸：His、Trp雜環亞氨基酸：Pro根據R基團的酸鹼性分類：酸性氨基酸