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Someoftheotheraminoacidsarephonetically语音学上suggestive.AminoAcid3lettercodeSinglelettercodeExplanationArginine
Phenylalanine
Tyrosine
TryptophanArg
Phe
Tyr
TrpR
F
Y
WaRginine
Fenylalanine
tYrosine
tWiptophan(or,containsDoublering)第31页,共69页,星期日,2025年,2月5日Fortheremaining5aminoacids,Dr.Dayhoffwasreachingsomewhattofindaneasy-to-rememberconnectionbetweenthesingleletterandtheaminoacid.?Sheassignedasparticacid,asparagine,glutamicacidandglutaminethelettersD,N,EandQ,respectively,notingthatDandNarenearerthebeginningofthealphabetthanEandQ,andthatAspissmallerthanGlu,whileAsnissmallerthanGln.?AminoAcid3lettercodeSinglelettercodeExplanationAsparticAcid
Asparagine
GlutamicAcid
GlutamineAsp
Asn
Glu
GlnD
N
E
QasparDic
ContainsN(orasparagiN)
gluE(orglutamEke)
Q-tamineBythetimeDr.Dayhoffgottolysine,therewerenottoomanylettersleft,sosheusedtheletterK,explainingthatKisatleastnearLinthealphabet.AminoAcid3lettercodeSinglelettercodeExplanationLysineLysKKisnearLinthealphabet第32页,共69页,星期日,2025年,2月5日修饰氨基酸:蛋白质合成后通过修饰加工生成的氨基酸。没有相应的编码。如:胱氨酸、羟脯氨酸(Hyp)、羟赖氨酸(Hyl)。非蛋白氨基酸:蛋白质中不存在的氨基酸。如:瓜氨酸、鸟氨酸、同型半胱氨酸,是代谢途径中产生的。第33页,共69页,星期日,2025年,2月5日1、酸水解常用6mol/L的盐酸或4mol/L的硫酸在105-110℃条件下进行水解,反应时间约20小时。此法的优点是不容易引起水解产物的消旋化。缺点是色氨酸被沸酸完全破坏;含有羟基的氨基酸如丝氨酸或苏氨酸有一小部分被分解;门冬酰胺和谷氨酰胺侧链的酰胺基被水解成了羧基。水解蛋白生成氨基酸的方法:第34页,共69页,星期日,2025年,2月5日2、碱水解一般用5mol/L氢氧化钠煮沸10-20小时。由于水解过程中许多氨基酸都受到不同程度的破坏,产率不高。部分的水解产物发生消旋化。该法的优点是色氨酸在水解中不受破坏。第35页,共69页,星期日,2025年,2月5日3、酶水解目前用于蛋白质肽链断裂的蛋白水解酶(proteolyticenzyme)或称蛋白酶(proteinase)已有十多种。应用酶水解多肽不会破坏氨基酸,也不会发生消旋化。水解的产物为较小的肽段。单一酶水解不完全。第36页,共69页,星期日,2025年,2月5日Section1AminoAcidsProtein1.ElementsofProtein氨基酸的性质第37页,共69页,星期日,2025年,2月5日蛋白质主要元素组成:C、H、O、N、S及P、Fe、Cu、Zn、Mo、I、Se等微量元素。
蛋白质平均含N量为16%,这是凯氏定氮法测蛋白质含量的理论依据:蛋白质含量=蛋白质含N量×6.25第38页,共69页,星期日,2025年,2月5日EssentialaminoacidAnessentialam
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