动物基因组学:蛋白质结构预测_(6).三级结构预测方法.docx

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三级结构预测方法

在上一节中,我们探讨了蛋白质结构预测的基本概念和二级结构预测方法。本节将重点介绍蛋白质三级结构预测的方法,这是蛋白质结构预测中最关键的一步,因为它涉及到蛋白质的空间构象,这对于理解蛋白质的功能至关重要。我们将从传统方法入手,逐步介绍现代基于人工智能的三级结构预测技术,包括深度学习和神经网络的应用。

传统方法

同源建模(HomologyModeling)

同源建模是最早且最常用的蛋白质三级结构预测方法之一。该方法的基本原理是通过已知结构的蛋白质(模板)来预测未知结构的蛋白质(目标)。具体步骤包括:

序列比对:将目标蛋白质的氨基酸序列与已

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