LY_T 2896-2017大熊猫种群遗传档案建立技术规程.pdf

ICS_ 65.020B 65LY中华人民共和国林业行业标准LY/T 2896—2017大熊猫种群遗传档案建立技术规程A regulation for giant panda population genetic archives2017-10-27发布2018-01-01实施国家林业局发布 LY/T2896—2017目次前言-范围2术语和定义采样额次、时间和路线.3.1采样额次与时闻3.2采样路线样品的采集和保存方法4.1采样工具4.2类便新鲜程度的判定4.3粪便样品的选取原则4.4样品采集方法4.5祥品记录与编号4,6样品的临时保存4.7祥品的运输和实验室保存-样品DNA的提取和保存方法5.1类便样品的DNA提取5,2DNA的保存遗传标记选用原则6.1线粒体标记6.2性别鉴定分子标记6,3微卫星标记实验流程7.1DNA质量检测和线粒体标记PCR扩增7.2个体识别7.3性别鉴定7.4速传多样性评估线粒体标记PCR扩增方法8.1引物合成8,2PCR扩增体系及程序大熊翁性别鉴定PCR方法*9.1PCR扩增引物的合成9.2PCR扩增体系及程序9.3电泳检测9.4性别判读10微卫星标记PCR扩增方法 LY/T 2896201712遗传档案数据的管理和使用对圈养大熊猫或野生大熊猫进行个体识别、亲子鉴定、性别签定、遗传档案建立和种群遗传多样性评估、种群遗传管理时，应统一使用本标准规定的分子标记；获得的所有数据要汇总建立大熊猫遗传档案数据库， LY/T 2896—2017附录V(规范性附录）大熊猫类便样品采集记录表表 A.1保护区大熊猫粪便样品采集记录表采样人：采样日期：天气：小区样品新鲜度北纬东经海拨取祥编号编号m团数生境简述-F01F02NFo1F02 LY/T 2896—2017附录（规范性附录）大熊猫微卫星标记编号、名称、核心序列及来源表 B.1大熊猫微卫星标记编号、名称、核心序列及来源表编号标记名称核心序列Genbank 号参考文献-298-6(SVVV)KF907161Huang et al, 20152gp2-47(OLVV)KF907176Huang et al, 20158pe-20(AAAG)KF907169Huang et al. 2015gp2-51(AGAT)uKF907179Huang et al. 20155GPL-29(ATCC)KF907139Huang et al. 2015GPL-60(TCTT)uKF907152Huang et al. 2015Ameμ10(CA)未注册Lu et al. 200190Ameμl1(CA)n未注册Lu et al, 2001Ame-μ13(CA)未性册Lu et al, 200110Ameμ15(CA)n未往册Lu et al, 200111Ameμ22(CA)n未往册Lu et al, 200112GPL-8(SOLV)KF907132Huang et al, 201513GPL-28(ATAA)nKF907138Huang et al. 201514gpy-5(AACT)wKF907157Huang et al. 201515py-20*(9LL.1)KF907159Huang et al. 201516GPL-53*(LLLV)KF907148Huang et al. 201517GPL-44(ATAA)aKF907146Huang et al. 201518Psnda-06(TG);(GT)64T9IAV比富军等.200519Pande-22(CAA)αAY161195沈富军等.200520Pands-05(GT)aAY161178沈富军等.200521Pande-40(TATC)AY161213沈富军等.200522Pande-44(TATC)AY161216沈富军等.200523Pande-45(TATC)(TATC)-(TATC),AY161217沈富军等.200524Amep24(VS)未注册Lu et al, 200125Ameμ26(VS)未性册Lu et al. 200126GP-01(CA)μA(CA);未往册张亚平等.199527GP-08(AC)GCAC末往册张亚平等.199528GP-901(CA)n未注册张亚平等.199529GPL-31(IOLV)KF907141Huang et al. 201530GPL-47(TCTA)KF907147Huang et al, 2015 LY/T 2896—2017附录c（规范性附录）大熊猫微卫星标记名称、PCR扩增引物及扩增长度表 C,1大熊猫微卫星标记名称、PCR扩增引物及扩增长度表编号标记名称引物序列(5-3)长度/bp-gp=-6F;CCTGGCAGGGCAAAGTATTR;C