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蛋白质组学医学院研究生课程2014概论PPT课件
抗体类别转换 * 前体的剪切 * 可变剪切 * 不同的剪切 * * RNA编辑 * 基因组学的局限 4、蛋白质翻译后修饰或者加工使得数量有限的编码基因产生数量巨大的蛋白质。 1)磷酸化 与信号传导、神经活动、肌肉收缩及细胞的增殖、发育和分化有关。 2)糖基化 糖基化的异常与疾病发生有关。 3)甲基化 组蛋白的甲基化对细胞分化、发育、基因表达、基因组稳定性等有关。甲基化异常与疾病有关。 4)乙酰化 组蛋白乙酰化与去乙酰化与基因转录有关。 5)泛素化 泛素化使蛋白质降解,与细胞分化与凋亡等生理过程有关。 * * Intein(可以剪切的蛋白质) * * Cyclic peptide * 基因组学的局限 5.基因组学不能解释蛋白质的时间和空间的动态变化。 1)个体发育的不同阶段或者细胞的不同活动时期,细胞内产生蛋白质可能不同,寿命可能也不一样。 2)蛋白质在细胞的不同部位时功能可能不同。 “立体细胞生物学”。 3)在细胞增殖、分化、衰老和凋亡中,蛋白质不仅具有表达时间、表达量的差异,而且还具有对外界化境刺激(生理信号、病理信号及外界物理、化学因素等)产生反应的能力。 A butterfly and a caterpillar have the same genome but different proteomes. * 基因组学的局限 6.基因组学不能解释蛋白质的相互作用网络。 1)蛋白质需要与其他蛋白质形成复合体来执行功能。同时可能形成不同的蛋白复合体,执行不同的功能。 2)蛋白质的相互作用、相互协调是细胞进行一切代谢活动的基础。 * 基因组学的局限 7.基因组学不能解释蛋白质的代谢过程。 * 基因组学的局限 8.基因组学解释不了蛋白质的结构与功能。 * 基因组学的局限 9.基因组学方法技术要求实现不了蛋白质研究的技术要求。 第一个蛋白质序列的测定:胰岛素,1951年; 第一个核酸测序:酵母的tRNA,1966年。 为什么蛋白质研究落后于基因的研究? * 基因组学的局限 10. 基因组学方法寻找级联放大的上游开关分子存在难度。 * 基因组学的局限 11. 基因组学方法不能对一些特定的生物样本进行分析。 * 12.在寻找靶标时力不从心。 蛋白质是各种代谢及调控途径的最主要的执行者,因此是许多致病因子对机体作用最重要的靶分子,是大多数药物的靶标乃至直接的药物(全世界制药业大部分新药的药靶是蛋白质,如受体、酶等)。 基因组学的局限 * 对蛋白质的数量、结构、性质、相互关系和生物学功能进行全面深入的研究已成为生命科学研究的迫切需要和重要任务。 * 过敏原免疫治疗(脱敏治疗)是目前唯一对因治疗的方法。 在众多变应原中,一般分为两大类:即吸入性变应原和食入性变应原,而吸入性变应原中尘螨是最主要的变应原,约占过敏性疾病患者阳性率的70-80%。 * 粉尘螨(Dermatophagoides farinae) 现已构建cDNA 文库,并已发现20多个尘螨过敏原。但由于没有全基因组序列,目前未能获得过敏原结构基因的序列,无法全面了解过敏原基因的结构、功能和调控等重要信息。 * 本项目的意义: 1、尘螨基因组全序列分析研究从根本上阐明尘螨过敏原基因结构与功能及其致病机制的研究; 2、为螨性过敏性疾病的诊断和治疗(粉尘螨基因工程重组疫苗研制)及预防奠定基础; 3、作为一种节肢动物(占生物界物种的75-80%),进化上意义重大;研究其内含子、转录因子、调控序列、重复序列等信息具有重要的生物学意义。 * 研究内容 粉尘螨基因组全测序; 粉尘螨转录组全序列测定; 粉尘螨 micro-RNA测定; 粉尘螨染色体核型分析(过敏原基因的定位) ; 重要功能基因元件与人类关键蛋白的受体、配件的相关研究 粉尘螨基因工程新型重组疫苗和诊断试剂的研制及其疫苗免疫治疗作用机理的研究。 * 新一代测序技术加快基因组研究 10~15分钟内完成一个人的完整基因测序。 1000美元/人。 * 基因组研究的意义 基因组序列图在分子层面上提供了一份生命“说明书”,不仅奠定了人类认识生命的基石,推动了生命与医学科学的革命性进展,为全人类的健康带来了福音。 阐明生命的进化、生长、发育、分化等生理过程的基础。 了解
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