il23th17通路基因及其交互作用与银屑病易感性研究-study on il 23 th 17 pathway gene and its interaction with psoriasis susceptibility.docx

英文缩略词表英文缩写英文全名中文全名CIConfidenceinterval可信区间SNPEDTAGWASSinglenucleotidepolymorphismEthylenediaminetetraacetateGenome-wideassociationstudies单核苷酸多态性乙二胺四乙酸全基因组关联分析研究HapMapHGPHLAHWEHumanHaplotypeMapHumanGenomeProjectHumanleukocyteantigenHardy-Weinberg人类单体型图人类基因组计划人类白细胞抗原遗传平衡LDMAFMHCLinkagedisequilibriumMinorallelefrequencyMajorhistocompatibilitycomplex连锁不平衡最小等位基因频率主要组织相容性复合物NF-κBOMIMODNuclearfactor-κ-bindingOnlinemendelianinheritanceinmanOpticaldensity核转录因子-κB人类在线孟德尔遗传吸光度ORPCRCNVOddsratioPolymerasechainreactionCopynumbervariations优势比聚合酶链反应拷贝数变异分析MDRHLAminMultifactordimensionalisyreductionHumanleukocyteantigenMinute多因子降维分析法人类白细胞抗原分sechbpSecondHourBasepair秒小时碱基对IL23/Th17通路基因及其交互作用与银屑病易感性研究硕士研究生王文菊研究生导师张学军教授杨森教授中文摘要研究背景：银屑病(Psoriasis)是一种常见的以红斑、鳞屑为主要临床表现的慢性、复发性、炎症性皮肤病。遗传学揭示其由多个微效基因与环境共同作用导致，基因交互作用在发病中起重要作用。IL23/Th17是近年来新发现的自身免疫疾病发病机制信号通路。国外已报道IL23/Th17通路多个基因与银屑病易感性相关。据此推断，IL23/Th17通路可能存在汉族人银屑病易感基因，且可能存在基因间交互作用。目的：搜寻和鉴定银屑病发病过程中IL23/Th17信号通路基因及其交互作用模型，为汉族人银屑病的发病机制、诊断和预测提供重要理论依据。方法：本研究从IL23/Th17通路中选出与汉族人银屑病发病相关的11个基因，选取的11个基因在1139银屑病病例和1694个对照样本中进行分型分析，通过多因子降维分析法（MDR）和logisticregressionalgorithms等方法，找出IL23/Th17信号通路相关基因在银屑病发病中的交互作用。结果：证实IL12B（SNPrs7709212，OR=0.77、P=2.69E-6）、TNF（SNPrs3093662，OR=3.38、P=1.72E-30）是汉族人银屑病易感基因；发现一个三维基因交互作用（IL21，CCR4和TNF(χ2=5.02(1),p=0.025)）、三个二维基因交互作用（IL12RB1和CCR4(χ2=11.66(4),p=0.0201)、IL22和CCR4(χ2=11.97(4),p=0.0176)、IL12RB1andIL6(χ2=7.31(1),p=0.0069)）在银屑病的发病中起着重要作用。结论：本研究证实了IL23/Th17信号通路基因及其交互作用在银屑病发病中起着重要作用。关键词：银屑病基因交互作用线性回归分析法多因子降维分析法Gene–geneInteractionsinIL23/Th17PathwayContributetoPsoriasisSusceptibilityinChineseHanPopulationAbstractBackgroundPsoriasisisacommonchronic,hyperproliferativeautoimmuneskindisease.Numerousstudieshaveprovedthattherewasastronggeneticsusceptibilityandamulti-factorialetiologyunderlyingpsoriasis,inwhichgene-geneorgene-environmentinteractionsmayjointlyaffecttheonset,manifestationandclinicalcourseofpsoriasis.IL23/Th17axiswasnewlyidentifiedpathwayintheetiologyofchronicinflammatorydiseases.Thegenesinthispathwaywerefoundtobeassoc