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材料分子设计导论5
* CO分子在Pd(110)表面的吸附 本例集中于一个吸附位置，短桥位，通过考虑(1x1)和(2x1)表面元胞，可以对能量分布进行计算，进而得到化学吸附能。 复习与练习 1. 构建计算模型 本例包含了五个不同的计算。为了便于管理，需要一开始就在根目录下建立五个子文件夹。 右击根目录选择New | Folder。重复这个操作四次。右击新文件夹，将其命名为Pd bulk。对其他文件夹重复这个操作，并将它们分别命名为Pd(110), CO, (1x1) CO on Pd(110) 。 2. 优化bulk Pd Pd的晶体结构包含在MS的晶体库中。计算方法采用LDA-CAZP 3. 构建并优化CO CASTEP的计算对象只能使周期性结构，因此，为了优化CO分子，需要把它放在晶格中进行计算，晶胞参数的a,b,c分别取3，2和2。优化后C-O键长约为1.16埃 5. 弛豫Pd(110)面 （可以跳过） 现在准备优化Pd (110)面。 CASTEP Calculation参数设置： 确认取消选择Optimize Cell, Quality选fine Properties选上 Density of states、Calculate PDOS，把k-point设置改为Medium. 在弛豫表面之前，必须把Pd内部的原子固定住，因为现在只需要弛豫Pd的表面。 按下SHIFT键，选中除了最上层的Pd原子之外的所有Pd原子。选择菜单条中的Modify | Constraints。勾选上Fix fractional position。 将gateway改为自己的计算机!!! 4. 构建Pd(110)表面 Cleave plane (h k l) 从-1 0 0 改为1 1 0 Fractional Depth为1.0。Top=0.5 Vacuum thickness的值从10.00改为5.00， *
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