第十九章_BioAnnotator.pdfVIP

第十九章 BioAnnotator 第十九章 BioAnnotator BioAnnotator 可以用來觀察基因序列和蛋白質序列的特性，例如GC 比例或 者是極性值。可由Vector NTI Advance 10 BioAnnotator 進入此程式(圖19.1) ： 圖19.1 使用程式集開啟BioAnnotator 或者從主程式中也可以直接把序列載入BioAnnotator 之中(圖19.2) ： 圖19.2 使用Vector NTI 主程式開啟BioAnnotator 215 Vector NTI 教育訓練手冊 進入BioAnnotator 後會出現如下畫面(圖19.3) ： 圖19.3 進入BioAnnotator 的畫面，圖表為分析結果，其縱軸為分析的數值，橫軸為長度 此畫面分為三個部份，最下面的部份是序列；左上方是描述序列的文字說明 檔案。右上方的圖形部份是分析的圖表結果。縱軸是分析的數值，橫軸是序列的 長度。 要分析序列的特性可由上方工具列的 選項，或者從Analyses→Analyses List 進入欲分析的項目(圖19.4) ： 圖19.4 分析序列特性時，選擇要分類的項目 216 第十九章 BioAnnotator 將使用者想要分析的項目，點選 或者滑鼠左鍵點擊兩下就會移到下方的 Selected analyses 視窗(圖19.5) ，可以複選： 圖19.5 點選 ，將分析的項目進行選取 分析的結果會依照使用者選取的順序顯示；如果想要改變順序可以選擇 選項或者是 選項進行移動；若要刪除則選擇 選項。選擇 選項可以調 整顯示的條件參數：在圖 19.6 中Window size 代表欲分析的長度。 圖19.6 設定分析畫面的大小 217 Vector NTI 教育訓練手冊 圖19.7視窗可調整圖形所要顯示的方式，可以選擇不同的表現方式和顏色 (圖19-8) 。 圖19.7 設定畫面顏色的呈現 圖19.8 對每一個項目，做不同的設定 218 第十九章 BioAnnotator 設定完成後點選OK 後就會出現分析的圖形(圖19.9) ： 圖19.9 設定完成的分析圖 圖形可以再調整，只要對圖形按下滑鼠右鍵後選擇Properties(圖19.10) ： 圖19.10 選擇Properties 做圖形調整 219 Vector NTI 教育訓練手冊 點選Properties 後就可以再次調整圖形的參數和表示方式(圖19.11) ： 圖19.11 設定圖形的參數及表現方式 想要把圖表輸出只要點選 選項，或者是點選滑鼠右鍵後選擇Camera 後 即可以複製輸入。圖形的次序可以點選 選項，將圖形拖曳改變次序(圖19.12) ： 圖19.12 利用Camera 進行複製儲存， 進行圖形的改變 220