静息态功能磁共振成像数据处理软件brant使用及详解.pdf

静息态功能磁共振成像数据处理 软件BRANT使用及详解 徐凯彬 中科院自动化所脑网络组中心 2016年09月03 日 北京 1 大纲  功能核磁数据预处理简介  软件操作  1. DICOM文件转换  2. 预处理  3. 检查配准头动  4. 计算指标统计  5. 显示  现场操作  测试数据  Raw_Data  Processed_Data 2 简介  BRAinNetome fMRI Toolkit (BRANT)  功能核磁处理软件  基于Matlab和SPM  brat (before 2016)  brant (2016-) 3 下载及安装  添加路径：  Set path-add with subfolders-选中brant和spm的文件夹  运行brant_check_paths Video:INSTALL  MATLAB 2015之后版本spm12, 其余MATLABspm8或spm12  Spm: http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/  辅助工具  Xjview : /xjview8/download/  Mricron: /rorden/mricron/install.html  必威体育精装版版本：/kbxu/brant  稳定版本：/en/brainnetometool/fmri-toolkit.html  帮助文档：本ppt 以及各个界面下的help或?按钮 4 数据及软件  1. 预处理数据  8个被试，60个时间点  被试信息和分组：subject_info.csv  2. DICOM数据  1个被试，240个时间点  3. 各个过程操作小视频及ppt  4. Matlab工具包 5 概览 预处理 6 1. DICOM文件转换 （brant-Utility-DICOM Convert） id index ：找到输出文件名位置 4 3 2 1 0 d:\raw_data\DICOM\subj1\fMRI\subj*.dcm id index为1时，输出文件名为fMRI ，会导致相互覆盖！