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[医药卫生]DNA甲基化

1942年,Conrad Hal Waddington 提出表观遗传学( Epigenetics)的概念,以此解释物种的内在基因与外观表现之间的关系。 基因序列(Genotype)的改变可能导致功能及表型(Phenotype)的改变。 基因型通过一些“偶然的、不确定的机制”决定了不同的表型。 —— 生物的不同特征完全随机获得 Waddingtons epigenetics Waddingtons epigenetics DNA双螺旋 基因的结构 现代表观遗传学 概念:基因的DNA序列不发生改变的情况下,基因的表达水平与功能发生改变,并产生可遗传的表型 —— 生物的不同特征由基因定向调控 表观遗传学的现象(基因表达的调控方式): DNA甲基化 表观遗传学的核心(最初始的调控方式) 组蛋白修饰 MicroRNA Genomic imprinting 真核生物基因表达调控层次: 1、DNA水平调节 2、转录水平调节 3、转录后水平的调节 4、翻译水平调节 5、翻译后加工的调节 DNA methylation的定义 DNA methylation是唯一发生在哺乳动物细胞内DNA 合成后的修饰作用,是调节基因表达的机理之一。 DNA甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。 DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而控制基因表达。 DNA methylation的定义 在甲基转移酶(DMNT)的催化下,DNA的CG两个核苷酸中的胞嘧啶(Cytosine)被选择性地添加甲基,形成5-甲基胞嘧啶(5-mC),这常见于基因的5‘-CG-3’序列 CpG 岛(cpg island) 结构基因组中70%~ 90% 的独立CpG 都被甲基化, 未甲基化的CpG 成簇地聚集形成CpG 岛 主要位于结构基因的启动子和第一外显子区域,约有60%以上基因的启动子含有CpG岛。 — 是结构基因启动子的核心序列和转录起始点 CPG island的功能:通过甲基化与去甲基化,调控下游基因的表达 —— 基因表达的调控开关 DNA methylation的生物学功能 在发育和分化中调控基因的表达; 特征性表型基因的表达(肤色、毛发) X染色体的失活(X-inactivation ) DNA甲基化生物学作用 IAP: intracisternal A particle 去甲基化:灰鼠基因(agouti)仅微量表达 甲基化:基因超量表达 X染色体的失活(X-inactivation ) 生长发育过程中,雌性哺乳类动物细胞中的两条X染色体其中一条失去活性的现象。 避免因拥有两条X染色体而产生 双倍的基因产物,保持和雄性动物 X染色体数量及功能上的一致性。 X染色体上存在一个与X染色体失活有密切联系的核心部位。核心区命名位X染色体失活中心(X-chormosome inactivation center,Xic),其定位在人Xq13区(Barr氏小体浓缩部位)。 研究发现失活的染色体上DNA序列都呈高度甲基化,导致绝大多数基因转录处于关闭状态。 X-chromosome inactivation 雌性家猫的一条X染色体完全失去活性 影响DNA methylation的调控因素 DNA 甲基转移酶(DNMT)的活性 哺乳动物体内有三种DNA 甲基化转移酶:Dnmt1、Dnmt3a 和Dnmt3b。 DNMT1--- 持续性DNA 甲基转移酶;与甲基化相关,缺乏引起基因组低甲基化,染色体缺失、重排、突变畸形 DNMT3a、DNMT3b--- 从头甲基转移酶;与去甲基化相关,在胚胎干细胞和早期胚胎中高度表达,缺乏引起胚胎死亡,在肿瘤组织中广泛高表达 正常小鼠 (Dnmt1 +/+) —— 阳性对照 DNM1酶缺乏小鼠模型 (Dnmt1 chip/–) —— 实验组 Embryonic stem (ES) 细胞 (Dnmt1 –/–) —— 阴性对照 Dnmt1 chip/–小鼠Dnmt1酶的表达量明显减少,大约为正常小鼠的10% 影响DNA methylation的调控因素 组蛋白的甲基化 真核生物的组蛋白N 末端或C 末端氨基酸残基可生乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化等共价修饰,并影响基因转录。 H3K9 的甲基化与DNA 的甲基化在基因的沉默机制中具有协同作用 H3K4 的甲

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