第17讲BLUP育种值估计 群体与数量遗传学 教学课件.pptVIP

种猪选择的信息来源 群体数量遗传学 第17讲 育种值估计6--BLUP 选择指数方法的前提条件 个体间不存在系统的环境条件 个体来自同一遗传基础的群体 个体间的遗传相关已知 BLUP的主要优点 动物模型BLUP充分利用亲属信息，消除固定环境及遗传效应产生的偏差，因而可以经常性地对来自不同年份、世代、饲养条件、畜群、年龄、信息量的个体进行可比性的遗传评定。 BLUP能做什麽？ 跨群体遗传估计 遗传参数估计 育种进展的评估 提高选择性状的种类 生产管理水平的比较 新技术的效果评估 一个个体的观察值 n个个体的观察值—估计s个体的育种值(sn) y:n个观察值的向量 b:所有系统环境效应的向量 X:b的关联矩阵 u:s个个体的育种值向量 Z：u的关联矩阵，当s=u时，Z=I。 当u和e服从正态分布 实际应用中 动物模型的混合模型方程组 举例:一性状 h2=1/3 育种值估计模型 模型的矩阵形式 A矩阵 混合模型方程组 方程组的解 生长性能育种值估计模型 母猪繁殖性能育种值估计模型 当前BLUP应用的主要效果 提高了选择效率 加快群体近交速度 不同遗传力性状BLUP法的效率 (Wray，1989 ) 不同选择方法的预期群体近交速度(%) BLUP方法的要求 资料结构 遗传参数 数据传输 计算机功能 专业软件 Costwood公司集团核心群育种方案 * 个体 子女 外祖母 外祖父 祖母 祖父 父亲 全同胞 半同胞 母亲 父亲其他亲属 配偶 母亲其他亲属 y和u的联合密度函数 A: s个个体间的遗传相关矩阵 猪场 个体 父亲 母亲 观察值 1 2 — — 225 1 3 — — 200 1 4 — — 255 2 5 1 3 250 2 6 1 3 198 2 7 2 4 245 2 8 2 4 260 2 9 2 4 235 y = X h + Za + e 第i个性状(1=DAY100kg，2=BF100kg)群体均 个体生长性能的观察值 出生时场年季性别固定效应 窝随机效应 虚拟遗传组固定效应 个体的随机遗传效应 随机剩余效应 总产仔数的观察值 总平均数 母猪产仔时场年季固定效应 母猪出生的窝效应 个体的随机遗传效应 母猪永久环境效应 随机剩余效应 选 择 方 法 遗 传 力 ? 0.1 0.2 0.4 0.6 个 体 1.0 1.0 1.0 1.0 个体+全同胞 1.08 1.07 1.04 1.01 个体+全同胞+半同胞 1.15 1.08 1.04 1.01 BLUP非顺序淘汰 1.28 1.13 1.06 1.02 BLUP(顺序淘汰) 1.33 1.20 1.12 1.05 选 择 方 法 遗 传 力 0.1 0.2 0.4 0.6 个 体 1.0 1.0 1.0 1.0 个体+全同胞 1.46 1.45 1.27 1.20 个体+全同胞+半同胞 2.07 1.94 1.58 1.37 BLUP非顺序淘汰 4.54 2.98 1.71 1.36 BLUP(顺序淘汰) 5.33 4.18 2.23 1.71 遗传评估中心 核心群1 核心群6 核心群5 核心群4 核心群3 核心群2 AI中心 *