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蛋白组学在肾脏病研究中的应用
2-D gel electrophoresis (2-DE) images of urine samples from diabetic nephropathy (DN) patients and healthy controls. NEPHROLOGY 2009; 14, 332–337 IgA肾病 Haubitz et al. (2005) 方法:CE-MS 差异: 正常对照(57例) IgAN特异性尿多肽谱 IgAN(45例):敏感性100%、特异性90% 膜性肾病(13例):敏感性77%、特异性100% 3种多肽masses:2752.4, 2427.1, 2057.3 Da 血清白蛋白片段 Kidney Int., 67(6):2313-2320. IgA肾病 Rocchetti et al. (2008) 方法:2DE和 nano-HPLC-ESI-MS/MS 病例:正常对照20例、 IgAN R(ACEI) 9例、IgAN NR 9例 差异蛋白:激肽原 , inter-α-trypsin inhibitor heavy chain H4 precursor (ITIH4),甲状腺素转运蛋白(transthyretin) 验证: IgAN R 和IgAN NR之间尿差异蛋白显著不同 免疫杂交:低水平的尿激肽原提示IgAN对ACEI治疗反应差的预测指标 Proteomics, 8(1):206-216. 肾小球肾炎 Mischak(2004-2005) 方法:CE-MS -生物信息的方法 构建一个尿液(和其他体液)蛋白质组诊断模型用于各种可以进展为肾衰的小球疾病的诊断和鉴别诊断。 MCD (16)、MN (18)、FSGS(10)与正常尿液(57) Kidney Int, 2004, 65(6): 2426-34 Kidney Int, 2005, 67(6): 2313-20 Mass Spectrom Rev. 2009; 28(5): 703–724. 肾小球肾炎 正常组多肽模式: 173 个在90% 以上正常人尿液中出现的多肽, 690 个在50%以上正常人尿液中出现的多肽, 疾病分别构建了含500 个以上多肽模式 对疾病分类的准确性: MCD/FSGS 71.4%,MN 92.9%。 Kidney Int, 2004, 65(6): 2426-34 Kidney Int, 2005, 67(6): 2313-20 Mass Spectrom Rev. 2009; 28(5): 703–724. 狼疮性肾炎 Mosley et al. (2006) SELDI-TOF MS 差异蛋白:m/z 3340 和3980 Da 活动和非活动LN:敏感性和特异性均92% 预测LN的复发与缓解 未作进一步鉴定 active (n= 26) and inactive (n= 49) lupus nephritis patients ROC curve for the two biomarkers was generated using logistic regression scores, with an area under the curve of 0.967. 狼疮性肾炎 Suzuki et al. (2009) SLE或青少年特发性关节炎:8种生物标记物 m/z of 2.7, 22, 23, 44, 56, 79, 100, 133 kDa(LN) 鉴定: 23-kDa:脂质运载蛋白型 前列腺素-D 合成酶 (L-PGDS), 56-kDa:α1酸性糖蛋白 (AGP) or类粘蛋白(orosomucoid,ORM) 79-kDa:转铁蛋白 (Tf), 133-kDa:铜蓝蛋白 (Cp) 其它:白蛋白或白蛋白片段 这些蛋白可能可作为预测LN病程 Pediatr Res. 2009 May;65(5):530-6. 狼疮性肾炎 Zhang et al. (2008) 方法:SELDI-TOF-MS 选择27/176种差异表达蛋白(不同活动期) 3中低分子生物标记物 Hepcidin的20、25氨基酸异构体 α1-antitrypsin片段 白蛋白 肝性杀菌肽(hepcidin) :与LN促炎症细胞因子有显著相关意义 Kidney International 74, 799–807 (2008) Urine SELDI spectra of class IV SLE nephritis flarecycles. (a) The spectra of a whole flare cycle are presentedbetween the 2000 and 10,000 Da reg
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