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物理图谱 遗传图所表现的是通过连锁分析确定的各基因间的相对位置;物理图则表现染色体上每个DNA片段的实际顺序,是指以已知核苷酸序列的DNA片段(序列标签位点,sequence-tagged site,STS)为“路标”,以碱基对(bp,kb,Mb)作为基本测量单位(图距)的基因组图。 用于确定各遗传标记间的物理距离有两种物理图谱: (1)以已定位的STS为位标,如序列表达标签(Expressed sequence tag,EST)以DNA实际长度为图谱距离的基因组图谱。 (2)由YAC和/或细菌人工染色体(BAC)连续克隆重叠群组成的物理图谱。 物理作图的方法 (1)限制酶作图 (2)依靠克隆的基因组作图 (3)荧光原位杂交 (4)序列标签位点作图 序列图谱(分子水平的物理图谱) 以某一染色体上所含的全部碱基顺序绘制的图谱。既包括可转录序列,也包括非转录序列,是转录序列、调节序列和功能未知序列的总和。 测序的策略有两个: 鸟枪法 克隆重叠群法 鸟枪法 克隆重叠群法(clone contig) 将基因组DNA切割长度为0.1Mb-1Mb的大片段,克隆到YAC或BAC载体上 然后再进行亚克隆,分别测定单个亚克隆的序列 再装配、连接成连续的DNA分子。 这是一种自上而下的测序策略 clone-by-clone method 组与组之间的关系 人类基因组的主要特征 各式各样的“体” 各式各样的“子” 单顺反子(真核生物)和多顺反子(原核生物) 内含子(主要是真核生物)与外显子 启动子与终止子(所有生物) 操纵子与操作子(原核生物) 弱化子或衰减子(原核生物) 增强子与沉默子(真核生物) 绝缘子(真核生物) 各式各样的“病毒” RNA病毒(HIV、HAV、HCV及流感病毒) DNA病毒(HPV、HBV和SV40) 朊病毒(疯牛病、羊搔痒病、克雅氏病、库鲁病):错误折叠的具有感染性的蛋白质 类病毒:为共价闭环的单链RNA分子,具有酶活性,只感染植物细胞 拟病毒(卫星病毒或类类病毒):单独不能感染宿主细胞;一般是为共价闭环的单链RNA分子,少数是DNA;一般感染植物细胞,少数感染动物细胞(如HDV) 巨型病毒:基因组的大小和基因的数目远远超过的一般病毒,如拟菌病毒和潘多拉病毒等 “中心法则”面面观 形形色色的表观遗传 组蛋白化学修饰产生的组蛋白密码对基因表达的影响 在DNA分子CpG岛上的C进行的甲基化修饰产生的第五个碱基对基因表达的影响 干扰RNA介导的基因沉默 雌性哺乳动物体内由Xist RNA介导的一条X染色体的转录失活 无处不在的碱基互补配对 RNA和DNA分子之中各种形式的双螺旋 DNA复制、DNA转录、RNA复制、逆转录 真核细胞内依赖于snRNA的mRNA剪接 真核细胞内依赖于snoRNA的rRNA的转录后修饰 锥体虫线粒体内依赖于gRNA的mRNA编辑 细菌细胞内翻译起始阶段依赖于SD序列的起始密码子的识别 翻译过程中密码子和反密码子的相互作用 真核细胞内由RNAi(microRNA和siRNA)介导的基因沉默 Southern印迹、Northern印迹、DNA芯片、荧光原位杂交(fluorescent in situ hybridization,FISH)和R环技术等 瞄准“中心法则”的抑制剂 “百花齐放”的信号肽 一般规则后的例外 细菌一般有细胞壁,但支原体没有 细菌细胞膜一般没有胆固醇,但支原体有 原核细胞基因组DNA一般只有一个,但霍乱弧菌和耐辐射菌却不止一个;原核基因组DNA一般是环状,但有些放线菌却含有线状基因组DNA 酶通常是蛋白质,但有核酶 DNA一般没有U只有T,但枯草杆菌的一种噬菌体只有U,没有T 操纵子一般存在于原核生物,但线虫也有操纵子 遗传密码是通用的,但线粒体内有例外 质粒一般是DNA,但有RNA质粒 质粒DNA一般是环状,但有线状质粒 质粒一般存在于原核生物,但有些真核生物甚至线粒体内也有 线粒体DNA一般是环状,但某些生物线粒体DNA却是线状 动物细胞一般有中心体,但一些低等动物没有;植物细胞一般没有中心体,但一些低等植物有中心体 一个基因编码多种蛋白质或多肽的秘密 DNA重排(如抗体和T细胞受体多样性的产生) 启动子的选择性使用 选择性剪接 选择性加尾 编辑 翻译过程中起始密码子的选择性使用 翻译水平的移框、通读和跳跃翻译 不同多肽或蛋白质从同一个蛋白质前体中的剪切释放 细菌、古菌和真核生物大比较 DNA复制、转录和翻译之比较 DNA的损伤与突变 分子生物学考点 各式各样的“组及组学” 各式各样的“体” 各式各样的“子” 各式各样的“病毒” 形形色色的表观遗传 无处不在的碱基互补配对 “中心法则”面面观 瞄准“中心法则”的抑制剂 一般规则后的例外 DN
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