基于RNA-seq技术的玉米CMS-C花药可变剪接和新转录本的研究-开题报告完成版PPT.ppt

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基于RNA-seq技术的玉米CMS-C花药可变剪接和新转录本的研究-开题报告完成版PPT

基于RNA-seq技术的玉米CMS-C花药可变剪接和新转录本的研究;内容;1 文献综述;1.1 植物雄性不育;;1. 4 可变剪接;1.4.1 可变剪接类型;在生物体内,主要存在7种可变剪接类型: A)Exon skipping; B)Intron retention; C) Alterna tive 5 splice site; D) Alternative 3 splice site; E) Alternative first exon; F) Alternative last exon; G) Mutually exclusive exon. ;1.4.2 中心法则与可变剪接;图 1-4 前体 mRNA 的构成性剪接和可变剪接事件;1.4.3 前体信使 RNA 的剪接过程;1.4.4 可变剪接的调控机制;影响剪接体识别剪接位点的序列信号通过与剪接因子等调控蛋白相结合对剪接起调控作用。其中:;芯片技术:剪接连接点芯片技术和外显子芯片技术 寡核苷酸探针固定在玻璃片,每组探针都和特定的外显子或剪接位点对应,原理如图1-11;1. 5 新转录本;2 课题研究的目的及意义;3 材料与方法;3.2.2 Clean Reads数据的获得及信息分析 ;测序评估;3.3 可变剪接分析;3.3.2 可变剪接序列特征与机制分析;3.3.3 可变剪接事件分析;3.3.4 雄性不育相关可变剪接分析;3.4 新转录本分析;3.5 RT-PCR验证新转录本和可变剪接;3.6 qRT-PCR验证可变剪接事件;4 预期结果;5 进度安排;Thank You !

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