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高通量测序法研究不同ph的饮用水对spf小鼠肠道微生物的影响

2017年7月 中国比较医学杂志 July,2017 第27卷  第7期 CHINESE JOURNAL OF COMPARATIVE MEDICINE Vol. 27  No. 7 研究报告 高通量测序法研究不同pH 的饮用水 对 SPF小鼠肠道微生物的影响 1,2# 2# 2 1∗ 余  强 ,刘月环 ,王志远 ,吴旧生 (1.浙江大学动物科学学院,杭州  310058;2.浙江省医学科学院,杭州  310013)     【摘要】  目的  研究不同pH饮用水对SPF小鼠肠道微生物多样性的影响。 方法  21 日龄SPF小鼠90 只 随机分成3组,每组30 只,分别给予三类水,即酸化水(pH30),中性水(pH70)和碱性水(pH90),并进行为期 三个月的饲养。 每组分别在饲养4周、8周、12周末各处死 10 只动物,取血清按 SPF 国标项目检测了细菌、病毒、 寄生虫,取回盲部内容物,根据细菌16S rRNA 的保守性设计引物,构建文库,进行高通量(Illumina)测序,获得10 G 的数据,并对数据进行统计,聚类分析。 结果  以pH 30 处理的小鼠肠道微生物丰富度适中,稳定性高。 结论  在规模化饲养条件下,选取pH30饮用水小鼠能较长时间维持肠道微生物多样性,稳定性达到一个平台。 本研究 为长期稳定维持动物质量的生产实践提供了理论与技术支持,也是胃肠道宏基因组学技术在动物质量控制领域的 一个具体应用。 【关键词】  肠道微生物;16S rRNA;高通量测序;饮用水;小鼠 【中图分类号】 R⁃33    【文献标识码】 A    【文章编号】1671⁃7856(2017)07⁃0040⁃08 doi:103969.j.issn.1671-7856 201707008 Effect of drinking water at different pH on intestinal microbial diversity in SPF mice evaluated by high throughput sequencing 1,2# 2# 2 1∗ YU Qiang ,LIU Yue⁃huan ,WANGZhi⁃yuan ,WUJiu⁃sheng (1.College of Animal Science,Zhejiang University,Hangzhou310058,China;2.Zhejiang Academy of Medical Sciences,Hangzhou310013)     【Abstract】  Objective  TostudytheeffectofdrinkingwateratdifferentpHonintestinalmicrobialdiversityinSPF

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