哈氏仿对虾线粒体16srrna和coⅰ基因的序列比较及其-水产学报.pdfVIP

第 40 卷 第 7 期 水 产 学 报 Vol. 40, No. 7 2016 年 7 月 JOURNAL OF FISHERIES OF CHINA July, 2016 文章编号: 1000–0615(2016)07–1006–12 DOI: 10.11964/jfc.20150609910 哈氏仿对虾线粒体16S rRNA和CO Ⅰ基因的序列比较及其与 仿对虾属之间的系统进化分析 1, 2 3 2 * 2 2 毛智超 ， 段亚飞 ， 刘 萍 ， 李 健 ， 陈 萍 (1. 上海海洋大学水产与生命学院，上海 201306 ； 2. 中国水产科学研究院黄海水产研究所，农业部海洋渔业可持续发展重点实验室，山东 青岛 266071 ； 3. 中国水产科学研究院南海水产研究所，农业部南海渔业资源开发利用重点实验室，广东 广州 510300) 摘要：为调查研究哈氏仿对虾浙江象山群体的种质资源、物种间的亲缘关系及遗传多样 性状况，采用PCR扩增获得哈氏仿对虾线粒体DNA 的16S rRNA 和CO Ⅰ基因片段，分别 对其进行序列比较和系统进化分析。16S rRNA 基因片段的T 、C 、A 和G 的含量分别是 35.76% 、19.48%、26.74% 和17.88% ；CO Ⅰ基因片段的T 、C 、A 和G 的含量分别是 35.36%、12.68%、30.54%和21.43% ；A+T含量显著高于G+C含量。16S rRNA基因片段长 度为558 bp ，共检测出1种单倍型，没有多态性位点；CO Ⅰ基因片段长度为688 bp ，共 检测出7种单倍型，6个多态性位点。CO Ⅰ基因片段比16S rRNA基因片段变异丰富，更 适于哈氏仿对虾种群的遗传多样性分析。基于16S rRNA 和CO Ⅰ基因片段的系统进化分 析结果不太一致，结合形态学分析表明，哈氏仿对虾是仿对虾属独立的分支，与细巧仿 对虾和亨氏仿对虾种类亲缘关系较近。根据CO Ⅰ基因片段的遗传距离推测出仿对虾属 的大致分化时间发生在中新世末期至上新世早期。 关键词: 哈氏仿对虾；16S rRNA基因；CO Ⅰ基因；序列分析；系统进化 中图分类号: Q 785 ；S 917.4 文献标志码: A [2] 哈氏仿对虾(Parapenaeopsis hardwickii) ，隶 人工育苗 等方面，而其遗传学方面的研究则相对 属于节肢动物门(Arthropoda) ，甲壳纲(Crustacea) ， 较少。 十足目(Decapoda) ，对虾科(Penaeidae) ，仿对虾属 线粒体基因结构相对简单，具有母性遗传 (Parapenaeopsis) ，是我国东海舟山渔场和南海粤 特点，进化速度较快且不易发生重组，是一种 [1] [4-6] 西外罗虾场重要的经济虾类 。哈氏仿对虾因其