第二章-2-微生物的分类和鉴定.pptVIP

第二章 微生物的分类和鉴定 目前已知的微生物种数为15～20万种，对它们进行分类、鉴定和命名等工作才能对纷繁的微生物类群有一清晰的轮廓。 生物种数：150万余种 微生物分类学(microbial taxonomy)是一门按微生物的亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群(taxon)的科学。它的具体任务有三，即分类(classification)、鉴定(identification)和命名(nomenclature)。 第一节 微生物的分类 ——分类的级别 一、微生物的系统分类单元 二、微生物的学名 一、微生物的系统分类单元 （一）七级分类单元 种以上的系统分类单元（taxon或category，也称分类阶元或分类群）自上而下依次可分七级，即： 　　界Kingdom（拉：Regnum） 　　 门Phylum（拉：Phylum）或Division（拉：Divisio） 　　 纲Class（拉：Classis） 　　 目Order（拉：Ordo） 　　 科Family（拉：Familia） 　　 属Genus（拉：Genus） 　　 种Species（拉：Species） 　　在这七级中，在必要时每一级都可有若干辅助单元，故共可有十余级。 （二）种的概念 种：最基本得分类单位 微生物的种：是一个基本分类单位，它是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有着明显差异的菌株的总称。 因为大多数原核生物的细胞形态过于简单，在高等生物中可用于定义种的几个主要性状，在微生物中是无法使用的。因此，在微生物尤其在原核生物中，种的定义极其难定，至今还找不到一个公认的、明确的种的定义。 模式种（typespecies 模式活标本） 在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株来作具体标本，这一典型菌株就是该种的模式种。 必须是一个种的具体活标本，是该菌种的活培养物，它应保持着纯培养状态，在性状上必须与原初描述密切相符。 模式菌株可用多种方式指定，例如可由原始作者指定，如原始菌株已丧失则可再提一个新的模式，等等。 常用的几种分类概念 种：亲缘关系较近的微生物有机体的集合，它们在进化发育阶段上有一定的共同形态和生理特征。现代分类学上规定种内菌株的DNA同源性≧70% 变种：从自然界分离到的微生物纯种，如果与典型种之间存在某些特征的差别，而这些特征又是稳定遗传的，则可将这一纯种称为典型种的变种。如枯草芽孢杆菌的黑色变种。 小种（亚种）：实验室中获得的微生物变异型称为小种或亚种。 型：自然界存在的差异较小的同种微生物的不同类型，称为型。如结核分支杆菌依其寄主的不同可分为人型、牛型和禽型。 菌株（品系）：来源不同的同种微生物的纯培养，均可称为菌株。 群：有些微生物的特征介于两种微生物之间，我们把这两种微生物及其中间类型统称为一个群 二、微生物的命名 每一种微生物都有自己的名字，包括俗名和学名两种。 （一）俗名 普通的、通俗的、地区性的名字，具有简明和大众化的优点，但往往涵义不够确切，易于重复，使用范围局限。例如： “结核杆菌”——Mycobacterium tuberculosis（结核分枝杆菌） “绿脓杆菌”——Pseudomonas aeruginosa（铜绿假单胞菌）； “白色念珠菌”——Candida albicans（白色假丝酵母）； “金葡菌”——Staphylococcus aureus（金黄色葡萄球菌）； “丙丁菌”——Clostridium acetobutylicum（丙酮丁醇梭菌）； “红色面包霉”——Neurospora crassa（粗糙脉孢菌）。 （二）学名 林奈的双名法——通常由一个属名加一个种名加词构成。属名词首需大写，种名加词字首需小写。 出现在分类学文献中的学名，在此两者之后往往还加上首次定名人（用括号括住）、现名定名人和现名定名年份，但在一般使用时，这几个部分总是省略的。即： 　 例1：大肠埃希氏菌（简称大肠杆菌） 　　Escherichia coli（Migula）Castellani et Chalmers 1919 　　例2：枯草芽孢杆菌（简称枯草杆菌） 　　Bacillus subtilis（Ehrenberg）Cohn 1872 　　例3：结核分枝杆菌 　　Mycobacterium tuberculosis（Zopf）Lehmann et Newmann 1896 　　例4：丙酮丁醇梭菌 　　Clostridium acetobutylicum McCoy，Fred，Peterson et Hast