药效团模型.PDF

计算机辅助药物设计 药效团模型方法 1 基于配体的药物设计方法  多数受体或酶的三维结构尚不清楚  药物分子的三维特征把握药物与受 体的作用  分类  药效团模型方法  定量构效关系分析 2 药效团模型方法  “药效团”  一系列活性化合物具有的共同特征。  包括的特征基团：  氢键基团、正负电荷基团和疏水基团等。 3 药效团模型原理  结合药效团信息  总结出对活性至关重要的原子或基团及它们 之间的空间关系  反推出受体的立体形状、结构和性质  推测得到靶点物质信息 H N O O H H O N H S N O H H N 4 药效团模型方法  定义：从一组活性化合物的结构出发， 确定化合物共同的药效作用模式，并 依此设计新的化合物。  药效团的三维排列方式 5 药效团模型方法意义 1 2 3 预测活性 数据库筛 先导化合 选 物的设计 6 药效团识别的基本步骤 1. 选择作用机制相似、活性高的化合物做 模板 2. 构象分析 3. 对分子构象进行叠合 4. 药效团的确证 7 常见的药效团模型软件  Catalyst— DISCOVERY accelrys公司  Phase  DISCO  GASP