国产百万亿次机群系统Alltoall性能测试与分析.pdfVIP

第37卷第8期 计算机科学 V01．37No．8 Science 2010 2010年8月 Computer Aug 国产百万亿次机群系统Alltoall性能测试与分析 饶立1张云泉1’2李玉成1 (中国科学院软件研究所并行计算实验室 北京100190)1 (中国科学院软件研究所计算机科学国家重点实验室 北京100190)2 摘要随着高性能计算机的应用和发展，并行应用程序所使用的处理器数越来越多，进程间的通信量也不断增多， 这对应用程序的性能有很大影响。在采用一种快速傅里叶变换HF盯对曙光5000A进行性能测试时发现，MPI集合 7000上进行性能测试与分析，以期对未来的Alltoall算法的优S．r-作做出贡献。利用不同消息长度和不同进程数测 试了Aihoall函数多种算法的性能，这些算法包括二维网格算法、三维网格算法、Bruek算法、原始算法、成对交换算 法、递归倍增算法、环算法以及LAM／MPI中的简单算法等。实验结果表明：消息长度较小时，在曙光5000A上采用 原始算法和Bruck算法的性能较好，而在深腾7000上用时较少的算法是简单算法和Bruck算法；对于长消息，曙光 5000A上最优的算法是环算法，深腾7000上成对交换性能最优。 关键词集合通信，Alltoall，曙光5000A，性能测试与分析 Domestic PerformanceTestand ofAlltoallCollectiveCommunicationon Analysis HundredTrillionTimesCluster System RAOLilZHANG LI Yun-quanl’2Yu-chen91 ofParallel of of 100190，China)1 (Lab Software。ChineseSciences，Beijing Computing，Institute Academy of (State of Science。InstituteofSoftware，ChineseAcademy 100190，China)2 KeyLaboratoryComputer Sciences，Beijing AbstractAs ofthe andmorecoresareusedandthuslendtO developmenthigh computers，more rapid performance test moreandmorecommunicationwhichdebasesthe of the ofthe parallelapp