真核链特异性有参转录组结题报告模板 - 基因帮.pdfVIP

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2017-08-02 发布于天津
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真核链特异性有参转录组结题报告模板 - 基因帮.pdf

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真核链特异性有参转录组结题报告模板 - 基因帮

项目编号：************ 基因帮项目结题报告项目名称: 真核链特异性有参转录组工程师: 成都生命基线科技有限公司 Chengdu life baseline technology co., LTD 项目编号：************ 目录一、概述5 二、工作流程6 1、实验流程6 1.1RNA检测6 1.2 链特异性文库构建7 1.3 文库质检8 1.4 上机测序8 2数据分析流程8 三、结果展示及说明9 1原始序列数据9 2 测序数据质量评估10 2.1 测序数据过滤10 2.2测序质量分布检查12 2.3 测序错误率分布检查12 2.4 A/T/G/C含量分布检查 13 2.5 测序数据质量情况汇总14 3与参考基因组比对15 3.1比对效率统计16 成都生命基线科技有限公司 Chengdu life baseline technology co., LTD 项目编号：************ 3.2Read在参考基因组不同区域分布统计 17 3.3Read在染色体分布密度统计18 3.4 比对结果可视化19 4 测序文库整体质量评估20 4.1mRNA 片段化随机性检验21 4.2 插入片段长度检验21 4.3 测序数据饱和度检验22 5 基因结构分析23 5.1 新转录本预测23 5.2 基因结构优化26 5.3 可变剪接分析26 5.4 SNP、Indel分析29 6 基因表达分析33 6.1 基因表达定量33 6.2 样品基因表达量总体分布35 7 基因差异表达分析36 7.1 重复相关性评估36 7.2 差异表达基因筛选37 7.3 差异表达基因数目统计40 7.4 差异表达基因聚类分析40 成都生命基线科技有限公司 Chengdu life baseline technology co., LTD 项目编号：************ 7.5 差异表达基因维恩图41 8 差异表达基因功能注释及富集分析42 8.1 差异表达基因 COG分类42 8.2 差异表达基 eggNOG分类43 8.3差异表达基因 GO