大豆根际未培养与培养细菌群落结构差异比较研究.pdfVIP

第26卷 第6期 大 豆 科 学 Vo1．Z6 NO．6 2007拄 12月 SOYBEAN SCIENCE Dec． 2007 大豆根际未培养与培养细菌群落结构差异比较研究 徐艳霞 ，王光华 ，金 剑 ，刘居东 ，张秋英 ，刘晓冰 (1．黑龙江八一农垦大学，大庆 163319；2．中国科学院东北地理与农业生态研究所，黑土生态实验室，哈尔滨 150081) 摘要 根际土壤微生物群落结构是根I~-Nc生态系统中的重要组成部分，与根际养分有效性、植物生 长发育及抗病性等关系密切，不同植物间、同一植物的不同基因型之间根际微生物群落结构差异较 大。利用从两种基因型大豆根际土壤中直接提取和从平板培养菌落提取的微生物DNA为模板， 采用细菌通用引物GC一357f和517r进行PCR扩增，对PCR产物的DGGE图谱进行聚类和主成分 分析。结果表明，不同基因型大豆根际土壤未培养的细菌群落结构差异不大，而在土壤浸提液和 NA培养基上形成的可培养的细菌群落结构受培养基种类和接种浓度(1O 和10 )影响较小，但 受不同大豆基因型影响而产生了差异。对DGGE条带进行分析表明，大豆根际未培养的细菌群落 物种丰富度(S)和多样性指数(H)明显高于可培养细菌，说明培养过程是一个再选择的过程，在这 个过程中一些微生物的信号得到放大，而大量的微生物信息缺失。对主要DGGE条带测序显示， 大豆根际有三大类细菌：拟杆菌门(BⅡc Pr0 P Ps)、变形杆菌门(Proteobacteira)和放线菌门(Acti— nobacteria)。变形杆菌门(Proteobacteira)中的 T—Proteobacteria、旷Proteobacteria和放线菌门 (Actinobacteria)，在未培养和培养细菌中都表现为优势种群。与培养细菌相比，变形杆菌门中的 fl-Protebacteria和拟杆菌门(Bacteroidetes)细菌在可培养细菌中占优势，而在未培养细菌中丰度较 低。结果证明，大豆根际细菌经培养后已使原有的群落结构发生改变，影响对原位细菌群落结构的 认识 。 关键词 大豆；根际；细菌群落；PCR—DGGE 中图分类号 S154．36 文献标识码 A 文章编号 1OOO一9841(2007)06—0907—07 CoMPARISoN oF BACTERIAL CoMMUNITY IN RHIZoSPHERE oF SoYBEAN BY ANALYSIS 0F 1 6S RDNA oBTAINED DIRECTLY FRoM SoIL AND CULTURE PLATE XU Yan—xia 。，WANG Guang—hua。，JIN Jian。，LIU Ju—dong。，ZHANG Qiu—ying。，LIU Xiao—bing。 (1．HP ￡0ng Ⅱng August First Land Reclamation University，Daqing 163319；2．Key Lab of Black Soil E— cology，Northeast Institute of Geography and Agroecology，Chinese Academy of Science，Harbin 100081) Abstract Microbial community in rhizosphere is an important component in rhizosphere ecosys— tems，which is closely related to the nutrient availability，plant growth and disease resistance． There are great differentiations in rhizosphere microbial community among plant species or even 收稿日期：2007—07—02 基金项目：黑龙江省科技厅“十一五”重点课题(GA06B101—3—1) 作者简介：徐艳霞(1981一)，女，硕士研究生，主要从事根际土壤微生物多样性的研究。 通讯作者