图位克隆法.pdfVIP

安徽农业科学,Journal of Anhui Agri .Sci .2008 ,36( 34) :14905 - 14906 责任编辑 张彩丽 责任校对 张士敏 水稻基因的图位克隆技术 吴自明 ( 江西农业大学, 作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室, 农业部双季稻生理生态与栽培重点实验室, 江西省作物生理生态与遗 传育种重点实验室, 江西南昌330045) 摘要 综述 了水稻图位克隆技术的原理、技术环节及其在水稻基因克隆上的应 用, 分析 了当前存在的主要 问题, 并对其应 用前景作 出了 展望。 关键词 水稻; 图位克隆; 基 因 中图分类号 S511 文献标识码 A 文章编号 0517 - 66 11( 2008) 34 - 14905 - 02 Map- based Cl oning Technique of Rice Genes WU Zi- ming ( Key Laboratory of Crop Physiology , Ecology and Genetic Breeding , Mi nistry of Education , Key Laboratory of Physiology , Ecology and Cultivation of Double Cropping Rice , Ministry of Agriculture , Key Laboratory of Crop Physiology , Ecology and Genetic Breeding of Jiangxi Province , Jiangxi Agricultural University , Nanchang , Jiangxi 330045) Abstract The principle and technical links of map- based gene cloning technique in rice and its applications in the gene cloning of rice were summa- rized . And the main existi ng problems at present were analyzed . And its application foreground was predicted . Key words Rice ; Map- based cloning ; Gene 近 年来 , 水稻基因组研 究进展 非 常迅速, 高密度遗传 图 合产生 的一种分子标记 。如 果不 同材料 间在 PCR 扩增 区域 谱和物理 图谱 的构建, 全基 因组序 列的公布, 数 以万计 EST 、 有SNP 位点, 且该位点是 限制 性 内切酶作 用位点, 那么不 同 全长c DNA 等序列及 功能分析数据 的释放 以及新型水稻 分子 材料的PCR 扩 增产物经特 定的酶切后 , 再进行琼脂糖凝胶 电 标记及 其高效检测技术的发展等 , 为基因的 图位 克隆带来 了 泳就会表现多态性 。当SNP 恰好位 于 限制性酶切 位点 比较 新的思路和方法 。同时, 这些新 的进 展也能够使基因 的精 细 少时, 这种情况可 以在 CAPS 标记 的基础 上通 过在 扩增 引物 定位和物理 图谱构建等相关工作 大大 简化, 使基 因的 图位 克 中引入错配碱基, 则可 以结合SNP 位点 引入新的限制 性 内切 隆朝着 更加简便、快速 的方 向发展 。 酶作用位 点, 产生和 CAPS 标记类似 的多态性, 这就 是dCAPS 1 图位克隆技术原理 的方法 。用 CAPS 或dCAPS 的方法 则可 以将几乎所 有的SNP 图位 克 隆( Map- based Cl oni ng) 又 称 定 位 克 隆( Positional 位点转化成 以PC