利用3个线粒体基因对马属动物系统发育的研究.pdfVIP

青 岛农业大学学报 (自然科学版) 31(4)：246～ 250，2O14 JournalofQingdaoAgriculturalUniversity (NaturalScience) 文章编号 ：1674—148X(2014)04—0246—05 利用 3个线粒体基因对马属动物系统发育的研究 陈建兴 ，潘庆杰。，孙玉江 ，陈海伟 ，李艳龙 ，张 彦 (1．赤峰学院生命科学院，内蒙古 赤峰 024000；2．青岛农业大学动物科技学院，山东 青岛266109 3．定西市岷县蒲麻镇畜牧兽医工作站，甘肃 定西 748406) 摘要 ：利用分子生物学软件 DNAMAN7．0对马属动物 3个线粒体基因(COX1、Cytb和ND4)的DNA序列进行 比 对分析 ，检测单核苷酸突变(SNP)位点，对马属动物 的系统发育进行分析 ，从分子水平上对马属动物 的遗传分化、 亲缘关系等方面 的鉴定提供依据 ，为马属动物的保护和开发利用提供参考 ，并为生物学教学提供教学资料。结果 表 明，马属动物的 3个线粒体基因存在丰富的遗传变异 ，能够揭示 出现存 马属动物 间的亲缘关系；利用 3种基 因构 建的系统发育树 的拓扑结构基本一致 ，对照 白犀牛群体作为外群 ，而马和普 氏野马序列首先聚在一起 ，3种亚洲野 驴 聚在一起 ，所有的斑马聚在一起 ，驴和斑马再聚在一起。 关键词 ：马属动物 ；线粒体 DNA；遗传分化 ；SNP；系统发育树 中图分类号 ：Q111．2．1 文献标识码 ：A D0I：1O．3969／J．ISSN．1674—148X．2014．04．003 DeterminationofthePhylogeneticRelationship inEquusAnimals BasedonThreeM itOch0ndrialGenes CHENJianxing ，PANQingjie，SUNYujiang。，CHEN Haiwei，LIYanlong 。ZHANGYan。 (1．CollegeofLifeScience，ChifengUniversity，Chifeng024000，China； 2．CollegeofAnimalScienceandTechnology，QingdaoAgriculturalUniversity，Qingdao266109，China 3．AnimalHusbandryandVeterinaryStationofPu-- maTown，M inCounty，Dingxi748406，China) Abstract：InordertoevaluateEquusgeneticdifferentiation，geneticrelationship，andprovidesomerefer— encesforEquusprotection，exploitationandteachingforbiology，thesequencesof3mitochondrialgenes COX1，CytbandND4inEquuswereused toalign to detectthesinglenucleotidepolymorphism (SNP) sitesforthephylogeneticanalysesofEquusbyDNAM AN7．0．Resultsshowedthattheabundantgenetic variationswerepresentin3mitochondrialgenes，whichcouldbeusedtorevealthegeneticrelationshipbe— tweenEquus；Thetopologicalstructuresofthephylogenetictreesconstructedbasedon3geneswerebasi— callythesame，andthewhiterhino sequenceswereallplacedastheoutgroup，andPrzewalskiihorsese— quencesgatheredwithhorsesequencefirstly；and3kindsofAsianwild