第5章蛋白质的三维结构2015-8-4.ppt

（一） 氢键 氢键 范德华力包括三种较弱的相互作用，即定向效应、诱导效应和分散效应。 定向效应：发生在极性分子间的力，它是永久偶极间的静电相互作用。氢键属于这种范德华力。 诱导效应：极性物质和非极性物质之间的相互作用。 分散效应：是在大多数情况下起主要作用的范德华力，它是非极性分子或基团仅有的一种范德华力。 生物化学领域的范德华力主要指狭义的范德华力（分散效应）；范德华力包括吸引力和斥力，吸引力用于稳定蛋白质的三维结构，斥力对蛋白质的三维结构也有重要的作用； 范德华力是很弱的，但是范德华相互作用数量大并且具有加和效应和位相效应，因此是一种不可忽视的作用力。当两个非键合的原子处于一定的距离（范德华距离或接触距离）时才能达到最大 它是正电荷与负电荷之间的一种静电相互作用。在生理pH下,蛋白质中的酸性氨基酸（天冬氨酸和谷氨酸）的侧链可离解成负离子，碱性氨基酸（赖氨酸、精氨酸和组氨酸）的侧链可离解成正离子。在多数情况下这些基团都分布在球状蛋白质分子表面，而与介质水分子发生电荷-偶极之间的相互作用，形成排列有序的水化层，这对稳定蛋白质的构象有着一定作用。 （五）二硫键 Select the type of tertiary interaction as: 1) disulfide 2) ionic 3) H-bonds 4) hydrophobic A. Leucine and valine B. Cysteine and cysteine C. Aspartic acid and lysine D. Serine and threonine 胶原蛋白结构中有共价交联. 疏水核心几乎全部由α-螺旋和β-折叠结构组成，主链上 polar groups (C=O and NH) are neutralized through formation of H-bonds. 多数α-螺旋为两亲螺旋 How does chaperon work? Hsp70 bind and release (partially) unfolded polypeptides and release them in a cycle driven by ATP binding and hydrolysis (i.e. it takes energy). They recognize them mainly due to hydrophobic patches that would normally be sequestered in the interior. Binding of unfolded polypeptides prevents them from aggregating. R-state vs T-state Binding Decreasing O2 affinity 下列有关蛋白质一级结构的叙述，错误的是B (A) 多肽链中氨基酸的排列顺序 (B) 氨基酸分子间通过去水缩合形成肽链 (C) 从 N- 端至 C- 端氨基酸残基排列顺序 (D) 蛋白质一级结构并不包括各原子的空间位置 (E) 通过肽键形成的多肽链中氨基酸排列顺序 关于蛋白质二级结构错误的描述是答案是 D (A) 蛋白质局部或某一段肽链有规则的重复构象 (B) 二级结构仅指主链的空间构象 (C) 多肽链主链构象由每个肽键的二个二面角所确 (D) 整条多肽链中全部氨基酸的空间位置 (E) 无规卷曲也属二级结构范畴 思 考 题 思 考 题 有关蛋白质三级结构描述，错误的是答案是 A (A) 具有三级结构的多肽链都有生物学活性 (B) 亲水基团多位于三级结构的表面 (C)三级结构的稳定性由次级键维系 系  (D) 三级结构是单体蛋白质或亚基的空间结构 (E) 三级结构是各个单键旋转自由度受到各种限制的结果 正确的蛋白质四级结构叙述应该为答案是 C (A) 蛋白质四级结构的稳定性由二硫键维系 (B) 蛋白质变性时其四级结构不一定受到破坏 (C) 蛋白质亚基间由非共价键聚合 (D) 四级结构是蛋白质保持生物活性的必要条件 (E) 蛋白质都有四级结构 1、蛋白质的一级结构决定高级结构和功能 牛胰核糖核酸酶变性和复性实验 2、 一级结构相似的蛋白质功能往往相似 同源蛋白质 3、 蛋白质一