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第十一章 RNA的生物合成(转录) RNA Biosynthesis, Transcription 中心法则 生物体遗传信息传递的方式 转录(transcription) 生物体以DNA为模板合成RNA的过程 复制 VS 转录 转录与复制的共同点 转录与复制的区别 基本内容: 第一节:转录的反应体系 (基本概念和酶、各种因子) 第一节 转录的反应体系 参与转录的物质 原料:核苷酸(NTP:ATP, UTP, GTP, CTP) 模板:DNA 酶:RNA聚合酶(RNA polymerase, RNA-pol) 转录因子(transcription factor, TF) 凡是转录过程必需的蛋白质,只要它不是RNA聚合酶的组成成分,就可以将其定义为转录因子 转录的模板 结构基因(structural gene): DNA分子上转录出RNA的区段 转录的模板 结构基因(structural gene): DNA分子上转录出RNA的区段 模板链(template strand),也称作有意义链或Watson链 转录的模板 结构基因(structural gene): DNA分子上转录出RNA的区段 模板链(template strand),也称作有意义链或Watson链 编码链(coding strand),也称为反义链或Crick链。 模板链、编码链与RNA的关系 不对称转录(asymmetric transcription) 在DNA分子双链上某一区段,一股链用作模板指引转录,另一股链不转录 ; RNA聚合酶 原核的RNA聚合酶 核心酶与σ亚基 原核RNA聚合酶的 σ亚基能识别启动子 σ亚基在转录开始后脱离核心酶 核心酶完成后续的转录过程 真核生物RNA聚合酶 真核生物的RNA聚合酶 模板上酶的辨认、结合 操纵子(operon) 通常由结构基因和多种表达调控元件在基因组中成簇串联组成。构成了原核生物中最常见的表达调控单位 启动子(promoter) 启动子:RNA聚合酶结合模板DNA的部位 RNA聚合酶保护法 一种巧妙的研究启动子序列的方法 原核生物启动子保守序列 真核生物启动子保守序列 真核生物的转录起始上游区段比原核多样化 小结: 转录体系:模板(DNA)、原料(4种NTP)、RNA聚合酶、其它转录因子 不对称转录:基因DNA双链中只有其中之一作为模板(模板链) 模板链:参与转录,指导生成RNA的单链 编码链:与模板链互补,与新生成的RNA仅有T与U的区别 小结: RNA聚合酶(RNA-pol):识别起始部位、解链、聚合、识别终止部位 原核生物的RNA聚合酶: 核心酶: α2β β’ σ亚基 真核生物的RNA聚合酶: I……45S rRNA(18S rRNA, 5.8S rRNA, 28S rRNA) II……hn RNA(mRNA前体) III……各种小RNA(snRNA,tRNA) 第二节 转录过程 转录的过程 转录起始 RNA的延长 转录终止 原核生物转录的过程 转录起始需解决两个问题: 原核生物的转录起始 RNA聚合酶全酶(?2????)与模板结合 原核生物转录的延伸 ?亚基脱落,RNA–pol聚合酶核心酶变构,与模板结合松弛,沿着DNA模板前移 转录空泡(transcription bubble) 超螺旋是转录的一个重要特征 原核生物转录的延伸 原核生物转录过程中的羽毛状现象 原核生物转录终止 指RNA聚合酶在DNA模板上停顿下来不再前进,转录产物RNA链从转录复合物上脱落下来。 依赖 Rho因子的转录终止 非依赖 Rho因子的转录终止 DNA模板上靠近终止处,有些特殊的碱基序列,转录出RNA后,RNA产物形成特殊的结构来终止转录。 茎环结构使转录终止的机理 回文序列导致RNA形成茎环结构 改变了RNA-pol的构象,使其停顿 RNA和DNA各自形成双链,使RNA/DNA杂化短链分开,释放RNA 小结(原核生物转录过程的): 起始: σ因子负责辨认转录起始位点 启动子:RNA聚合酶识别、结合、起始转录的DNA序列(如,TATA box) 延长:核心酶 核心酶(α2ββ’) 终止: 依赖ρ因子 非依赖ρ因子 终止子:DNA序列上回文结构 真核生物的转录起始 真核生物转录起始十分复杂,往往需要多种蛋白因子(转录因子)的协助,它们与RNA聚合酶Ⅱ形成转录起始复合物,共同参与转录起始的过程。 转录起始上游的DNA序列 顺式作用元件(cis-acting element) “cis-”有“分子内”的意思
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