第十一章微生物的分类和鉴定讲课.pptVIP

第十一章 微生物的分类和鉴定 第一节 微生物在生物界的地位 第二节 微生物的分类和命名 第三节 微生物分类鉴定的方法 第四节 微生物的分类系统 第五节 微生物的快速鉴定和自动化分析技术 生物界的分类 第一节 微生物在生物界的地位 二、三域学说的建立和发展 （1）古生菌域（Archaea) ：包括产甲烷细菌、极端嗜盐菌和嗜热嗜酸菌等 （2）细菌域（Bacteria) ：包括蓝细菌和各种除古细菌以外的其它原核生物 （3）真核生物域（Eukarya）：包括原生生物、真菌、动物和植物 第二节 微生物的分类和命名 有关学名的其他知识 属名：是一个表示该微生物主要特征的名词或用作名词的形容词，单数，第一个字母大写。 种名加词：又称种加词，它代表一个物种的次要特征，字母一律小写。 属名和种名都是由拉丁词、希腊词或其他拉丁化的外来词或以组合方式拼成。 按规定，学名均应按拉丁字母发音规则发音。 第三节 微生物分类鉴定的方法 rRNA具有重要且恒定的生理功能 在16SrRNA分子中，既含有高度保守的序列区域，又有中度保守和高度变化的序列区域，因而它适用于进化距离不同的各类生物亲缘关系的研究； 16SrRNA分子量大小适中，便于序列分析； rRNA在细胞中含量大(约占细胞中RNA的90%)，也易于提取； 16SrRNA普遍存在于真核生物和原核生物中(真核生物中其同源分子是18SrRNA)。因此它可以作为测量各类生物进化的工具。 二、微生物分类鉴定中的现代方法 2、核酸的分子杂交法 核酸分子杂交(hybridization)间接比较不同微生物DNA碱基排列顺序的相似性。 是比GC比更细致和更精确的遗传性状指标。 不同生物DNA碱基排列顺序的异同直接反映生物之间亲缘关系的远近，碱基排列顺序差异越小，它们之间的亲缘关系就越近，反之亦然。 3、rRNA寡核苷酸编目分析 普遍存在与一切细胞中 生理功能即重要又稳定 细胞中含量高，易提取 编码rRNA的某些核苷酸序列非常保守 相对分子质量适中 （二）细胞化学成分用作鉴定指标 细胞壁的化学成分 全细胞水解液的糖型磷酸类脂成分的分析 枝菌酸的分析 醌类的分析 气相色谱技术用于微生物的鉴定 第四节 微生物的分类系统 放线菌：中国科学院微生物研究所编著的放线菌目分科、分属检索表。 真菌：真菌界分类系统很多，各国采用不同的系统，比较混乱。近年来为较多人接受的是Ainsworth的纲要。 Smith、 Alexopoulos 、 Ainsworth的分类系统 第五节 微生物的快速鉴定和自动化分析技术 SUMMARY 了解生物分类的通用分类单元； 掌握微生物在生物界的地位； 掌握微生物的分类和鉴定的依据； 了解微生物分类鉴定的主要参考书； 了解微生物的快速鉴定方法。 思考题 什么是学名？举例说明什么是双名法？ 微生物分类的依据主要有哪些？ 1、提纯rRNA 2、用T1RNA 酶水解 3、双向电泳分离 4、得到指纹图谱 5、对比分析 基本原理：用一种RNA酶水解rRNA后，可产生一系列寡核苷酸片段，如果两种或两株微生物的亲缘关系越近，则所产生的寡核苷酸片段的序列越接近，反之亦然。 （三）数值分类学（统计分类学） p365 表10－6 数值分类学与传统分类法的比较 《伯杰氏鉴定细菌学手册》 (Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology) 美国宾夕法尼亚大学的细菌学教授伯杰(D.Bergey)(1860-1937) 1957年第七版后，由于越来越广泛地吸收了国际上细菌分类学家参加编写(如1974年第八版，撰稿人多达130多位，涉及15个国家；现行版本撰稿人多达300多人，涉及近20个国家)，所以它的近代版本反映了出版年代细菌分类学的必威体育精装版成果，因而逐渐确立了在国际上对细菌进行全面分类的权威地位。 细菌分类系统 《伯杰氏系统细菌学手册》 (Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology) 伯杰氏手册是目前进行细菌分类、鉴定的最重要依据，其特点是描述非常详细，包括对细菌各个属种的特征及进行鉴定所需做的实验的具体方法。 （20世纪80年代末期） 形态和生理生化特征是最常用的细菌分类、鉴定指标 1、 API 细菌数值鉴定系统 （API System） 菌种 基本培养基 （液体） 菌悬液 检测、编码、查表、鉴定 适用于API鉴定细菌有700多种 2、Enterotube 系统 不同培养基分装不同小槽中，同步接种，培养后检测、查表、鉴定。 3、Biolog全自动或手动细菌鉴定系统 在96孔的细菌培养板上检测微生物对不同发酵性碳源利用情况进行的分类鉴定。 自动化、快速 可鉴定细菌有1140多种、酵母菌