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卷曲螺旋

卷曲螺旋 7.88J 蛋白质折叠 Prof. David Gossard September 24, 2003 PDB Acknowledgements 蛋白数据库(The Protein Data Bank, PDB - /) 是世界上专一 的用于处理和发布生物大分子三维结构的知识库。 Berman, H. M., J. Westbrook, Z. Feng, G. Gilliland, T . N. Bhat, H.Weissig, I. N.Shindyalov, and P. E.Bourne. The Protein Data ” Bank. Nuclei c Acids R es earch 28 (2000): 235-242. (PDB Advisory Notice on using materials available in the archive : /pdb/advisory .html) 7.88J 蛋白质折叠 “卷曲螺旋”课堂笔记中 所使用的蛋白分子和索引 PDB编号:2ZTA JRNL reference: O Shea, E. K., J. K. Klemm, P. S. Kim., and T . Alber. X-ray structure ” of the GCN4 leucine zipper, a twostranded, parallel coiled coil. Science 254 (1991): 539. 页面:3 ( 大纲”),14-15 ( GCN4亮氨酸拉链”) 大纲 l 复习卷曲螺旋的关键特征 l 考察一个特定的例子 GCN4亮氨酸拉链(2ZTA) 卷曲螺旋 l 右手螺旋中的左手螺旋 l 也许是平行的 N N 或者是反平行的 个标准的卷曲螺旋 l GCN4 l 原肌球蛋白 l 中间体 l filament prot l Lamin l M-蛋白 l 副肌球蛋白 l 肌球蛋白 克里克模型 l 螺旋的几何构型(卷曲螺旋) ω 0 右手方向 o R(t) P x(t) = r cos(ω t) o o y(t) = r sin(ω t) o o z(t) = P (ω t /2π) o 卷曲螺旋

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