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丝组及组丝二肽蛋白质的相互作用

V 上67663l 摘要 10年前,赵玉芬院士负责的研究小组发现了磷酰化氨基酸具有自组装功能, 并以此提出了磷酰化氨基酸是生命化学进化的最基本单元的理论,并相继发现 了基于这一理论的产物磷酰化丝氨酸、丝组二肽具有核酸、蛋白质以及脂的切 割功能,这些生物活性分子所具有的功能可以说体现了现代酶的雏形,也进一 步验证和提升了“磷酰化氨基酸是生命化学进化的最基本单元的理论”。同时, 这些发现对著名的“RNA世界”的理论提出了挑战,为从化学进化的角度探索 生命起源提供了全新的视角。特别是越来越多的蛋白质酶作用机制的研究表明, 丝氨酸和组氨酸是许多蛋白酶活性中心必不可少的功能氨基酸。丝组二肽切割 功能的发现,说明了丝氨酸和组氨酸作为活性中心的主要功能氨繁酸是蛋白酶 长期进化和选择的结果。 本研究利用变性聚丙烯酰胺擞胶电泳(sDs_PAGE)、荧光分光光度技术、圆 定量、底物选择性、切割机制等方面进行了较为深入的研究,并对组丝二肽(IIS) 与蛋白质的相互作用进行了相应的对比研究。同时对利用丝组二肽的蛋白质切 割功能设计模拟抗体酶以及利用竞争ELSIA法筛选肽活性物质的方法进行了探 索。主要研究结果如下: 1, 系下,当反应温度为50℃时的切割速度为4.63×i0~mM/hr,其切割活性相 割,而柠檬酸却对sH的切割具有抑制作用。 2, 通过用SDS—PAGE结合荧光光谱技术研究发现丝组二肽对蛋白质的 切割活性具有一定程度的底物选择性,主要表现为对a一螺旋含量较高的蛋白质 切割活性较低,而对D折叠以及自由LOOP区含量较高的蛋白质具有较高的切 割活性。利用LC/MS/MS对切割碎片进行分析发现,在蛋白质的~级结构上, SH对蛋白质的切割具有一定程度的氨基酸序列偏好性,主要表现为其高频短裂 点在甘氨酸位点。其二级结构的选择性和序列偏好性的一致性说明蛋白质的位 阻效应是影响SH二肽中丝氨酸羟基亲核进攻肽键的主要因素之一。 3, 在用荧光光谱技术对丝组二肽的切割活性进行实时跟踪时发现,丝 组二肽在近中性的室温条件下,可以对GFP的荧光产生一定程度的淬灭作用, 而组丝二肽却表现出对GFP荧光的增强作用,同时其淬灭或增强的程度同样表 现出一定程度的底物选择性。通过用CD与SDS.PAGE相结合的方法对丝组与 组丝二肽与GFP的这种相互作用关系的研究发现,丝组与组丝均可以与GFP发 生一定程度的弱相互作用,用SDS可以在室温条件下捕获到HS与GFP 结合的一条滞后的结合带,用标准分子量方法估算出HS与GFP的结合量为 1l一29个HS/P。 4, 丝组二肽与组丝二肽弱相互作用的圆二色性分析结果表明,在GFP 溶液中加入丝组二肽对GFP的立体构像影响不大,说明引起荧光淬灭的主要原 因是sH与GFP的弱相互作用影响了GFF对激发光的吸收,从而表现出GFP荧光 强度的下降。而Hs的作用则正好相反。 5, 探讨了利用竞争法酶联免疫技术(ELSIA),对合成肽库中的肽活性 物质进行初步筛选的可行性。结果表明,二肽以及二肽类似物的蛋白质切割活 性与ELSIA结果具有很好的一致性,说明该技术可以作为肽库活性物质的初选 技术。 6, 探讨了基于丝组二肽切割功能的模拟抗体酶设计的可行性,设计了 3种sH与乙肝抗原可变区融合表达的融合蛋白,利用生物传感技术对其切割功 能进行了测试,结果发现虽然融合蛋白仍然保留了原有抗体的抗原结合活性, 但并没有实现预期的对特异抗原的l刃割。可能的原因是与抗体融合后的sH链其 构像的改变不利于sH对蛋白质的切割,因此有待于对sH的联接的方式以及与 蛋白质的连接臂. that wereformed Ten discoved by group polypeptides yearsago,our th

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