应用rpoB与16SrDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术对山羊瘤胃细菌多样性的研究.pdfVIP

卷 期 ! # 微 生 物 学 报 !（）： # #% ’ #%( 年 月 日 #$$ ! ! !#$ %’()(*(+$ ,-$ ! )*+,- #$$ !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!! 应用 ’. ( ! 和#$ %’( 基因的变性梯度凝胶电泳技术 对山羊瘤胃细菌多样性的研究 8 8 8 8 # 石鹏君 ，柏映国 ，袁铁铮 ，姚 斌 ，范云六 8 # （中国农业科学院 饲料研究所 生物技术研究所 北京 8$$$%8） 摘 要：采用免培养的 和 基因的变性梯度凝胶电泳技术（ ）对 种山羊（波尔山羊，内蒙古绒山 +*2 80K +.L) .MM; 4 羊，四川南江黄羊）瘤胃细菌优势菌群结构进行了比较分析。研究结果显示 !# 2 .MM; 图谱中条带数目少于 80K +.L) 图谱，并且条带分离效果明显，更有利于分析瘤胃细菌群落组成。从两种 图谱中均可以发现 种山羊 .MM; 4 瘤胃细菌具有一定的相似性，种内个体间相似性明显高于种间相似性，这说明寄主品种是影响瘤胃细菌种群构成 的一个重要因素。同时进行了部分优势细菌 80K +.L) 基因N07N% 区序列的系统发育分析。基因序列分析表明， 图谱中优势条带的 基因序列中有 条克隆的序列与基因库最相似菌的相似性大于 ，余下的克 .MM; 80K +.L) ! ( O 隆序列相似性在 之间，其中 条序列的与之相似性最高的序列均来自于未被鉴定的瘤胃细菌。 %( O ’ (0 O 84 关键词： ； 基因；编码 聚合酶 亚基（ ）基因；瘤胃细菌；遗传多样性 .MM; 80K +.L) PL) ! !#$ 中图分类号： 文献标识码： 文章编号： （ ） Q(4% ) $$$870#$( #$$ $#7$#%7$ 瘤胃是一个复杂的生态系统，是被公认的作为 同品种山羊瘤胃优势细菌种群的组成进行揭示和比 ［，］ 研究胃肠道系统最好的材料之一8 # 。从 8%!4 年首 较，描述瘤胃细菌种类的变化。 次在反刍动物的瘤胃内发现微生物时起，人们对其 材料和方法 的研究已有 80$ 多年。瘤胃微生物种类繁多，包括 古细菌、细菌、真菌和原生动物。其中瘤胃细菌种类