山东省猪种mtDNA+CytB基因遗传多样性与系统进化研究.pdfVIP

第十一次全国畜禽遗传标记研讨会论文集 山东省猪种mtDNA CytB基因遗传多样性及系统进化研究六 王继英L2，郭建凤L2．，王诚L2，张印L2，王怀中L2，武英1’2“ (1山东省农科院畜牧兽医研究所，济南250100； 2山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室，济南250100) 摘要：【目的l利用mtDNA 12个猪种166个样本(8个山东省 CytB基因为标记，从分子水平探i．-t 猪种，3个引进猪种，梅山猪种)的遗传多样性和当枯种间的亲缘关系，为山东省秸种A理利用以及生 物多棒陛保护提供基础资料和科学依据．【方法】对各猪种样本mtDNACytB基因进行PCR扩增和测序， 采用现代生物信息学方法进行数据处理分析．【结果】山东8猪种种内遗传变异和种间遗传距离均较小， 有共事单倍型．山东各猪种与梅山猪和大约克的遗传距离也较小，但和引进猪种杜洛克和长白的遗传距 离较大．利用分子系统进化树和CytB基因的4个SNP位点的分类方法均将上述样本分为2个独立的支 系，第一支中国猪种为主，将除鲁烟白猪的—种单倍型在内的所有山东猪种、梅山猪和大约克的两种单 倍型聚为一类，第二支引进猪种为主，将长白、杜洛克、大约克的一种单倍型和鲁烟白猪的—种单倍型 聚为一类．【结论】一是山东各猪种有共同的母系祖先，品种内母系遗传多棒I生较贫乏．二是外来猪种 引入山东后主要是用作父本以提高生产速度和瘦肉率等性能，对本地猪种未有母系贡献；三是利用CytB 基因4个SNP位点对欧洲单倍型和亚洲单倍型的分类方法，可以方便地估测利用中外猪种结合培育的猪 新品种(配套系)的母系血统情况． 关键词：山东省猪种；mtDNA；cyta；遗传多样陛；系统进化 J记载，有莱芜黑猪、 【本研究的重要意义】山东省具有丰富的猜种资源，据{Ih东省畜禽品种志》II 大蒲莲猪、烟台黑猜、沂蒙黑猪、里俞黑猪、昌潍[J猪和五莲黑猪等，另外还有通过国家畜禽品种资源 委员会审定的鲁烟白猪(2007)。lII东省地方猪品种资源巧i仅表现在品种数量多，而凡各品种具有繁殖力 高、肉质好、适应性强等优良的种质特性。但在市场经济的冲击下，大量的国外猪种引入，一方面，严 重影响了l【J东省猜种的纯度和种质特性的保存，另一方而，许多地方猪种正而lI{}i灭绝的危险。伞面了解 当前山东省猪种的遗传资源状况和阐明与其他猪种的亲缘关系，是合理、有效保护及开发利用的前提条 件。虽然对山东省猜种资源进行了多次规模不等的调查，但从未从分子水平上对山东各猪种的遗传多样 DNA，mtDNA) 性和猪种问的亲缘关系进行研究。【前人研究进展】高等动物线粒体DNA(Mitochonddal 遗传上具有自主性及遵循严格的母系遗传，其母系遗传方式可缩减有效检测种群的大小，线粒体的有效 种群数量是核基因标记有效种群数量的四分之一，取样时需要较少的样本数量就可代表一个种群，提高 了对遗传漂变的敏感性。细胞色素B(CytochromeB，CytB)基因是线粒体DNA中重要的蛋白编码基因， 进化速率适中，且易用一些通用引物扩增和测序．就其结构和功能而言，也是目前研究得最为清楚的基 因之一，所以是研究动物种内和近缘种问的系统发育、起源进化的良好分子标记之一即J，广泛用于各种 家畜的系统发育、进化和分类的研究中Ml。【本研究切入点】本研究对山东各猪种(莱芜黑猪、大蒲莲 黑猪、里岔黑猪、烟台黑猪、沂蒙黑猪、五莲黑猜、昌潍臼猪和鲁烟臼猪)及引进猪种(杜洛克、大约 克和长白猪)mtDNA CytB基因进行PCR扩增和测序，并采用现代生物信息学的数据处理方法，从分子 水平分析各猜种种群内的遗传多样性以及与各猪种种问的亲缘关系，为山东省猪种的合理利用和生物多 样性保护提供基础资料和科学依据。【拟解决的关键问题】各猪种有代表性样本的采集，和采用了现代 101) 源描述标准与共享平台建i及(2005DKA21 ’’通讯作者：武英(1957一)，女，山东肥城人．研究员，研究方向为猪遗传育种和营养．E-mail：wusaas@i63．c