我国部分黄牛品种线粒体D-loop区遗传多样性与起源分化.pdfVIP

篷 HEREDITAS(Beijing)2009年2月，31(2)：160—168 ISSN0253-9772 WWW．chinagene．ca 研究报告 DoI：10．3724，sP．J．1005．2009．00160 我国部分黄牛品种线粒体D-loop区遗传多样性与起源 分化 张桂香 ，郑友民 ，王志刚 ，韩旭 ，贾善刚 ，陈宏 1．全国畜牧总站，北京 100125； 2．西北农林科技大学动物科技学院，杨凌 712100 摘要：为了解我国地方黄牛品种线粒体DNA的遗传变异情况，文章测定了16个地方黄牛品种206个个体线粒 体D—loop区的全序列，共检测到 101个变异位点；99种单倍型，其中73种是普通牛单倍型，26种是瘤牛单倍型； 平均核苷酸差异为22．6920，单倍型多样度为0．9320，核苷酸多样度为0．0227，表明我国黄牛品种遗传多样性非 常丰富。构建的NJ进化树显示 16个品种来源于两大母系：普通牛和瘤牛；构建的Network图表明73种普通 牛单倍型可以分为3大单倍型群；26种瘤牛单倍型分为5种单倍型群，推测我国瘤牛在迁移过程中，至少经历 了4次群体扩张事件 通过分析 比较地方黄牛品种与内罗门牛共有的 H3单倍型，发现其中只有 16％的序列与 内罗门牛的H3单倍型非常相似，其余 84％的序列均发生了乌嘌呤变异，推测这些变异很可能是我国瘤牛固有 的变异。 关键词：黄牛；D—loop区；遗传多样性；起源；分化 GGeenneettiiccOdiivveerrssiittyyaanndoorrliginofmmiittoocchhoonnadrriiaaDNAAD-hlOOpprreeRgi1Oonn ofsomeChineseindigenouscattlebreeds ZHANG Gui—Xiang ，ZHENG You—M in ，W ANG Zhi—Gang ，HAN Xu ，JIA Shan—Gang ， CHEN Hong 1．NationalAnimalHusbandryService，BeOing100125，China； 2．CollegeofAnimalScienceandTechnology，NorthwestA＆FUniversity．Yangling712100．China Abstract：111ecompleteD—loopregionofmitochondrialDNA from 206individualsin 16Chineseindigenouscattle breedswassequencedandnaalyzedtodetectvariabilityofD—loopregionofmitochondriaDNA forthosebreeds．There— suitsshowedasfollows：101variationsnad99haplotypeswerefound，inwhich73haplotypeswereofBostaurusnadhte other26haplotypeswereofBosindicus，nadtheaveragenumberofnucleotidedifferenceswas22．6920，haplotypediversity was0．9320，andnucleotidediversitywas0．0227，indicatinghighgeneticdiversityinChineseindigenouscattlebreeds．Ac- cordingtohteNJphylogenetictree．16cattlebreedsweredividedintotwoclades．BOStaurusandBosindicus．Basedonhte Networkgraphics，hte73haplotypesofBostauurswereclassifiedinto3groupsandthe26haplotypesofBosindicuswere classifiedinto5groups．ItwasinferredthatcattlebreedsofBos ndicusinChinahadexperiencedatleast4populationex— pnasionsduringhteirmovement．Therewasonly16％ofH3haplotypesequnencessimilartothesequenceofNellore，nad 84％of