柑橘碎叶病毒分离株全基因组遗传多样性及遗传进化分析.pdfVIP

802025

年第

56

卷第

6

期

邓国荣，谢祥恩，张朝玉，等.

柑橘碎叶病毒分离株全基因组遗传多样性及遗传进化分析

[J].

福建农业科技，2025，56（6）：80−86.

柑橘碎叶病毒分离株全基因组遗传

多样性及遗传进化分析

1,211,21,21,2

＊

邓国荣，谢祥恩，张朝玉，邓越英，陈毅群

（1.

南雄市农业农村局，广东南雄512499；2.

南雄市乡村振兴服务中心，

广东南雄512400）

摘要：为明确柑橘碎叶病毒（Citrustatterleafvirus，

CTLV）的遗传多样性及进化特征，对

7个不同柑橘种的41份CTLV分离株全基因组进行遗传多样性及遗传进化分析。结果表明：不

同柑橘种的41份CTLV分离株碱基组成呈AT偏好，碱基转换与颠换比值为2.875～5.112，核苷

酸多样性Pi值为0.030～0.177，单倍型多样性Hd值为0.900～1.000；中性检验值多为负值且不

显著，表明种群未历经扩张事件；非同义突变与同义突变比值在0.059～0.754，为负向选择；分

子变异分析（AMOVA）中FST值为0.193，种群间存在较大遗传分化，且变异主要源于种群内

部；系统进化分析表明，CTLV分离株的聚类不存在明显的寄主特异性。研究显示41份

CTLV分离株具有高核苷酸和单倍型多样性，基因突变和负向选择是其遗传进化的关键驱动力，

而寄主差异对CTLV遗传进化影响较小。

关键词：柑橘碎叶病毒；遗传多样性；全基因组；遗传进化

中图分类号：S436.66文献标志码：A文章编号：0253−2301（2025）06−0080−07

DOI:10.13651/ki.fjnykj.2025.06.011

GeneticDiversityandEvolutionAnalysisofCompleteGeomeofCitrustatterleafvirusIsolates

1,2

1

1,2

1,2

1,2

＊

DENG

Guo-rong,

XIE

Xiang-en,

ZHANG

Chao-yu,

DENG

Yue-ying,

CHEN

Yi-qun

（1.

BureauofAgricultureandRuralAffairsofNanxiong,Nanxiaong,Guangdong512499,China;

2.

NanxiongRuralRevitalizationServiceCenter,Nanxiong,Guangdong512400,China）

Abstract:In

order

to

clarify

the

genetic

diversity

and

evolutionary

characteristics

of

Citrustatterleafvirus

(CTLV),

the

whole

genomes

of

41

CTLV

isolates

from

7

different

citrus

species

were

analyzed

by

genetic

diversity

and

gene