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园艺与种苗,HorticultureSeed2025,45(03):15-17,23doi:10.16530/21-1574/s.2025.03.006
enome-wideIdentificationandAnalysisofMembersoftheCOMTTranscription
FactorFamilyinCapsicumannuum
G
辣椒COMT转录因子家族成员全基因组鉴定与分析
林婉盈,廖万兰,王晓,乔英豪,刘生财
(福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建福州350002)
摘要:[目的]鉴定辣椒COMT基因家族成员,探究其对辣椒盐胁迫的响应,为辣椒抗逆高产育种提供帮助。[方法]基于拟
南芥COMT基因筛选辣椒COMT基因家族,并利用生物信息学方法对辣椒COMT基因家族进行基因染色体定位、重命名、
蛋白质理化性质分析、构建系统进化树、保守基序、蛋白结构和基因结构的分析。[结果]从辣椒基因中鉴定出59个COMT
基因家族成员,分别分布于10条染色体上,蛋白质分子质量差异较大,大多数属于稳定蛋白,除一条外均属于两性蛋白。与
拟南芥构建进化树后发现辣椒COMT基因家族与拟南芥COMT基因家族亲缘关系较远,可将CaCOMT分为3个亚组,亚组
内各成员拥有多数相同的保守基序,基因结构上外显子数量也接近,可见亚组内成员的亲缘关系较近。[结论]该研究为研究
CaCOMT基因功能奠定了基础。
关键词:辣椒;咖啡酸-O-甲基转移酶(COMT);生物信息分析;盐胁迫表达
中图分类号:Q81文献标识码:A文章编号:2095-0896(2025)03-015-03
LINWan-yingetal.(InstituteofHorticulturalBiotechnology,FujianAgricultureandForestryUniversity,
Fuzhou,Fujian350002)
Abstract[Objective]InordertoidentifythemembersoftheCOMTgenefamilyinCapsicumannuumand
exploretheirresponsetosaltstress,andprovidehelpforhigh-yieldbreedingofC.annuum.[Method]TheCOMT
genefamilyofC.annuumwasscreenedbasedontheCOMTgeneofArabidopsisthaliana,andthechromosome
mapping,renaming,physicalandchemicalpropertiesofproteins,phylogenetictreeconstruction,conserved
motifs,proteinstructureandgenestructurewereanalyzedbybioinformaticsmethod.[Result]59membersofthe
COMTgenefamilywereidentifiedfromtheC.annuumgene,whichweredistributedon10chromosomes
respectively.Themolecularweightoftheproteinswasverydifferent,mostofthembelongedtostableproteins,
andallofthembelongedtoamphotericproteinsexceptone.AfterconstructinganevolutionarytreewithA.
thaliana,itwasfoundthattheCOMTgenefamilyofC.annuumwasdistantlyrelatedtotheCOMTgenefamilyof
A.thaliana,andCaCOMTcouldbedivide
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