梅花鹿鹿茸顶端茸皮组织PIM1基因生物信息学及表达分析.pdfVIP

李梦茹，宋雪晴，李想，等.梅花鹿鹿茸顶端茸皮组织PIM1基因生物信息学及表达分析[J].中国草食动物科学，2024，44（6）：27-31

DOI：10.3969/j.issn.2095-3887.2024.00.087

梅花鹿鹿茸顶端茸皮组织PIM1基因生物信息学及表达分析

李梦茹，宋雪晴，李想，路鑫浩，夏彦玲

（东北林业大学野生动物与自然保护地学院，哈尔滨150040）

摘要：为了研究梅花鹿（Cervusnippon）PIM1基因的结构和功能，利用RT-PCR技术扩增梅花鹿PIM1基因，获得

该基因的cDNA序列，对PIM1基因及其蛋白的基本性质进行生物信息学分析，并根据PIM1蛋白的同源序列对

比结果构建系统进化树，同时对PIM1基因在鹿茸生长前、中、后期顶端茸皮组织中的相对表达量进行检测。

结果表明，梅花鹿PIM1基因的CDS序列全长942bp，共编码313个氨基酸；PIM1蛋白是一种亲水性较强且无

信号肽的不稳定蛋白，主要定位在细胞质和细胞核；同源性分析可知，梅花鹿PIM1蛋白与白尾鹿、黇鹿、马鹿

的PIM1蛋白氨基酸序列相似度高达98.50%以上；PIM1蛋白的二级结构由43.45%的无规则卷曲、36.10%的

α-螺旋、12.78%的延伸链以及7.67%的β-转角组成；实时荧光定量RT-PCR结果表明，PIM1基因在鹿茸生长

后期的表达量极显著高于生长前期（P0.01）和生长中期（P0.01）。说明PIM1基因可能在梅花鹿鹿茸生长后

期起着促进骨化的作用。

关键词：梅花鹿；PIM1基因；基因克隆；生物信息学分析；实时荧光定量RT-PCR

中图分类号：S825.2文献标志码：A文章编号：2095-3887（2024）06-0027-05

BioinformaticsandExpressionAnalysisofthePIM1Geneinthe

ApicalVelvetSkinTissueofSikaDeerAntlers

LIMengru,SONGXueqing,LIXiang,LUXinghao,XIAYanling

(NortheastForestryUniversityCollegeofWildlifeandProtectedArea,Harbin150040,China)

Abstract:InordertostudythePIM1genestructureandfunction,thePIM1geneofCervusnipponwasclonedbyRT-

PCR,andthecDNAsequenceofthegenewasobtained,thebasicpropertiesofthePIM1geneanditsproteinwereana‐

lyzedwithbioinformaticsmethods,andaphylogenetictreewasconstructedaccordingtotheresultsofthecomparison

fromthePIM1proteinhomologoussequences.TherelativeexpressionofthePIM1genewasdetectedatthepre-

growth,mid-growth,andlate-growthstagesoftheapicalantlerskintissues.TheresultsshowedthatthePIM1geneof

SikadeerwassuccessfullyamplifiedbyRT-PCR,whichwas942bpinlengthandencoded313aminoacids.ThePIM1

proteinwasunstableandhadhighhydrophilicityandnosignal