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作物杂志Crops2025(1)54-65DOI:10.16035/j.issn.1001-7283.2025.01.007
高梁Dof基因家族鉴定及表达分析
付森杰1宋迎辉1朱灿灿1叶珍言1秦娜1
刘海霞2
代书桃1文王春义1孕
李君霞1
(河南省农业科学院粮食作物研究所,450002,河南郑州;2长葛市农业农村局,461500,河南许昌)
要DNA结合单锌指蛋白(DNAbindingwithonefinger,Dof)是植物中特有的一类转录因子,参与调控植
摘要
物组织分化、种子萌发、植物抗逆及代谢等生理生化过程。为鉴定并分析高梁Dof转录因子家族成员,利用生物
信息学方法从全基因组水平对高梁Dof转录因子家族成员的基本基因结构、理化性质、保守基序、启动子顺式作
用元件、组织特异性表达及干旱胁迫表达等进行分析。20%PEG6000模拟干旱胁迫处理豫梁10号的幼苗后,利
用qPCR技术分析Dof基因家族成员响应不同时间段干旱胁迫的表达情况。结果共鉴定了30个高梁Dof基因,
分布在9条染色体上,基因保守性分析结果显示,Motifl(即锌指结构)是高梁Dof基因家族中保守的蛋白质序
列;其中29个基因中都含有CX2CX21CX2C保守基序,而SbDof15基因保守序列为CX20CX2C;启动子结构分
析表明,基因的启动子区域中含有、MYB、MeJA、低温等逆境胁迫响应元件;进化树分析结果表明,
DofABA
高梁Dof蛋白与玉米的同源性更高,热图分析表明Dof家族成员在高梁的不同部位都有表达。qRT-PCR结果表
明,高梁Dof基因家族成员可能参与高梁应对干旱胁迫的响应,不同的Dof基因成员在应对干旱胁迫时的调控机
制可能不一样。
关键词高梁;Dof基因家族;转录因子;全基因组鉴定;PEG处理
高梁(Sorghumbicolor)是原产于热带的抗旱C端的氨基酸序列不具备保守性,不同种类的氨
及抗盐碱较强的禾本科粮食作物[1],主要种植于干基酸能与不同的DNA序列结合,且该区域也是调
旱及盐碱地区,由于高梁具有抗逆能力强、耐盐控基因表达的重要部分,这使得Dof蛋白的功能
碱、耐旱和耐高温[2-3]等优良特性,越来越受到重具有多样性。而N端大约由52个氨基酸组成,又
视。高梁用途广泛,在高端酿酒、畜牧饲料及工叫保守结构域,能够特异识别序列5-AAAG-3的
业淀粉等方面发挥重要作用。近年来,高梁被作顺式作用元件[8-10]。在该结构域中有4个保守的
为优质的能源植物,在完成高梁全基因组测序后,Cys残基[1]。
有关高梁基因家族的挖掘及相关功能的研究也越Dof转录因子参与植物种子胚乳发育过程中
来越多,但尚未见关于高梁Dof基因家族成员的种子储藏蛋白合成、种子萌发、防御机制、碳氮
研究报道。代谢相关基因光调控、叶片组织分化及衰老等过
转录因子(transcriptionfactors,TF)能够与启程,在植物的生长发育中起着关键作用[12-13]。植
动子上的光响应元件(G-box)等顺式作用元件结物中发现的第1个Dof基因是ZmMNB1,它通过结
合,调控下游基因的表达[4]。近年来,越来越多转合MNF1启动子上的AAGG序列进而参与C4植
录因子的功能被挖掘,其中Dof蛋白是一类植物特物光合作用的表达调控[14]。此后,越来越多的植
有的转录因子,Dof基因家族属于单锌指蛋白超家物Dof基因被深入研究。如过表达OsDof12基因
族,一般由200~400个氨基酸构成[5],因其N末端可以使转基因水稻的花期提前,在长日照条件下提
含有一个C2C²型锌指结构,被称为Dof(DNA前开花[15],过表达GhDof1基因能够上调与胁迫相
bindingwithonefinger)[6]。Dof蛋白由N末端的关基因GhSOD及GhMYB的
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