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1·56·中国药理学通报ChinesePharmacologicalBulletin2025Jan;41(1):156~63
网络出版时间:2024-12-1615:51:33网络出版地址:https://link.cnki.net/urlid/34.1086.R1300.044
网络药理学
综合微阵列数据分析与动脉粥样硬化程序性细胞死亡
相关的lncRNAmiRNAmRNA竞争内源性网络
杨琼,宋月月,贾雨涵,盖秩舶,杨雯晴,张丹
(山东中医药大学,中医药创新研究院,山东济南250355)
doi:10.12360/CPB2024040567种lncRNA介导的ceRNA对焦亡的调控途径和23种ln
文献标识码:A文章编号:1001-1978(2025)01-0156-08cRNA介导的对铁死亡与自噬的调控途径。结论该研究
中国图书分类号:R319;R32925;R3422;R5435;RR5911构建了与程序性细胞死亡相关的ceRNA网络,有助于我们
摘要:目的基于生物信息学挖掘与程序性细胞死亡相关的了解程序性细胞死亡导致AS的作用机制。
ceRNA网络在AS病理生理过程中的作用,以期为AS的诊
断和治疗提供新的靶点。方法从GEO数据库筛选关键词:动脉粥样硬化;GEO数据库;铁死亡;自噬;焦亡;
GSE97210和GSE28858数据集,筛选差异表达的lncRNA、CeRNA网络
mRNA和miRNA,而后基于ceRNA理论在Cytoscape372软
件中构建lncRNAmiRNAmRNA调控网络。其次对ceRNA
开放科学(资源服务)标识码(OSID):
网络中的mRNA进行GO和KEGG富集分析。再将ceRNA
网络中的mRNA与自噬、焦亡和铁死亡相关的基因取交集,
构建与程序性细胞死亡相关的ceRNA网络。结果共获得动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)是指发生在
1208个DElncRNA、4723个DEmRNA和139个DEmiRNA。动脉壁的内膜和中间层的一种与年龄呈正相关关系
构建了一个由64个lncRNA、8个miRNA和167个mRNA组的慢性炎症性疾病[1]。其是各种心脑血管疾病发
成的ceRNA网络。ceRNA网络中的mRNA主要在转录和迁病的病理基础,目前其发病机制尚不十分清楚,这也
移的正调控以及蛋白结合等生物功能和PI3KAkt信号通是其导致心血管疾病死亡的主要原因[2]。因此,迫
路、mTOR信号通路等信号通路中显著富集。最终,构建了切需要进一步研究和深入了解AS的分子和生物学
机制。
收稿日期:2024-09-20,修回日期,2024-12-10
近年来,随着微阵列和测序技术的发展,越来越
基金项目:国家自然科学基金资助项目(N;山东省高等
多的研究用于揭示与AS相关的非编码RNA。长链
学校“青创团队计划”(No2022KJ257);山东省自然科学
基金(NoZR202212050026)非编码RNA(lncRNA)被定义为长度超过200个核
作者简介:杨琼(1997-),女,硕士生,研究方向:中医治疗心系疾苷酸的非编码RNA,越来越多的研究表明,lncRNA
病,Email:13253750725@163.com;参与调节内皮细胞功能、血管炎症和脂质代谢等多
杨雯晴(1987-),女,副教授,硕士生导师,研究方向:中种疾病过程[3]。最近的研究发现,lncRNA也可能在
医治疗心系疾病,通信作者,Email:winnie0416q@1
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