基于加权基因共表达网络分析及机器学习构建铁死亡相关基因在多囊卵巢综合征的疾病模型及相关中药预测.pdfVIP

基于加权基因共表达网络分析及机器学习构建铁死亡相关基因在多囊卵巢综合征的疾病模型及相关中药预测.pdf

  1. 1、本文档共9页,可阅读全部内容。
  2. 2、有哪些信誉好的足球投注网站(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
  3. 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载
  4. 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
  5. 5、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
  6. 6、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们
  7. 7、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
  8. 8、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多

2024年6月第30卷第6期June.2024Vol.30No.6中医询导排

引用:唐昕燃,陈顺德,崔立生,胡真榕,沈浮,彭芮.基于加权基因共表达网络分析及机器学习构建铁死亡相关

基因在多囊卵巢综合征的疾病模型及相关中药预测[J.中医药导报,2024,30(6):133-140,166.

基于加权基因共表达网络分析及机器学习

构建铁死亡相关基因在多囊卵巢综合征的

疾病模型及相关中药预测

唐昕燃,陈顺德,崔立生,胡真榕,沈浮,彭芮

(湖南医药学院附属永州市中医医院,湖南永州425000)

[摘要]目的:利用机器学习分析铁死亡基因与多囊卵巢综合征(PCOS)的相关性,构建诊断及预后风险模

型,探讨PCOS的潜在铁死亡机制,并预测相关中药。方法:多芯片标准化合并CEO数据库的卵巢组织芯片,采用

加权基因共表达网络分析(WGCNA)算法筛选与PCOS相关的铁死亡特征基因,对特征基因进行功能富集分析,

利用多种机器学习进行构建并筛选疾病模型,提取最优的疾病特征基因,并构建风险模型,分析其与免疫浸润

细胞及功能之间的相关性,对铁死亡基因进行中药及小分子化合物预测,并对小分子化合物与铁死亡靶点进行分

子对接验证。结果:共提取26个铁死亡与PCOS的强相关交集靶基因,主要在铁死亡通路中的Xc-系统和铁

代谢通路上发挥作用。通过WGCNA结合机器学习筛选以HMOX1、IFNA1、LPCAT3、FOXO4和PARP3为特征基

因的RF模型有较优的模拟特性,并通过绘制列线图来预测各基因表达的患病风险性。上述模型基因与PCOS的

发病呈正相关性。免疫浸润分析提示多种免疫细胞在两组之间存在显著浸润差异,预测的中药中丹参、三七可能

是其潜在的分子药物来源,分子对接中丹酚酸B、葛根素与黄芪甲苷A的匹配程度最高。结论:以HMOX1、IFNA1、

LPCAT3、FOXO4和PARP3为特征基因的铁死亡相关基因模型可为早期识别和治疗POCS提供新思路。铁死亡相

关基因可通过干预多种途径在PCOS中发挥重要作用,中医药在干预PCOS中可能通过调节铁稳态代谢来介导

铁死亡途径。

[关键词]多囊卵巢综合征;铁死亡;加权基因共表达网络分析;机器学习;疾病模型;GEO数据库;中药预测

[中图分类号】R271.14[文献标识码]】A[文章编号】1672-951X(2024)06-0133-08

D0I:10.13862/43-1446/r.2024.06.024

ConstructionofDiseaseModelforFerroptosis-RelatedGenesin

PolycysticOvarySyndromeandPredictionofRelatedTraditionalChinese

MedicineBasedonWeightedGeneCoExpressionNetworkAnalysisand

MachineLearning

TANGXinjian,CHENShunde,CUILisheng,HUZhenrong,SHENFu,PENGRui

(YongzhouTraditionalChineseMedicineHospitalAfiliatedtoHunanMedicalCollege,

您可能关注的文档

文档评论(0)

实用文库 + 关注
实名认证
服务提供商

专注于各类实用性文档的撰写、修改、润色,擅长各类PPT文案的定制,同时收集有海量规范类文档,欢迎各界朋友垂询!

1亿VIP精品文档

相关文档