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分子植物育种,2024年,第22卷,第16期,第5252-5260页
MolecularPlantBreedir16,5252-5260
研究报告
ResearchReport
白凤菜转录组学分析及类黄酮基因的剖析
黄建军*谢伟容郑晓艳
漳州卫生职业学院药学院,漳州,363000
*通信作者163.c0m
摘要白凤菜,是一味闽南地区及中国台湾著名的中草药,其作用多样,但近年来研究较少,特别是分子
研究匮乏。本研究选择IluminaHiSeqTM平台对白风菜的叶和茎进行了高通量测序,研究结果表明:一共拼接
成93975个高质量的unigene,其N50为1146bp,平均长度为624.78bp;与基因本体数据库等七大数据库
进行实验结果对比辨析,共有56455个unigene至少顺利注释一个数据库,全部注释的有2005个unigene。在
白凤菜叶对根差异表达中共获得3286个unigene,其中上升趋势表达1852个,下降趋势表达1434个。利
用KEGG数据库,找到参与类黄酮生物合成的有39个unigene,具有显著差异的有11个,分布在12个合成
酶中。此结果为进一步研究白凤菜黄酮类化合物生物合成和调控的分子机制提供理论基础,
关键词白凤菜;高通量测序;类黄酮;生物合成
TranscriptomeAnalysisandFlavonoidGeneAnalysisofGynuraformosana
Kitam.
HuangJianjun*XieWeirongZhengXiaoyan
SchoolofPharmacy,ZhangzhouHealthVocationalCollege,Zhangzhou,363000
*Correspoauthot
ond163.com
DOI:10.13271/j.mpb.022.005252
DOI:10.13271/j.mpb.022.005252
AbstractGynuraformosanaKitam.isafamousChineseherbalmedicineinsouthernFujianandTaiwan,China.
Itsfunctionsarediverse,butthereislittleresearchinrecentyears,especiallymolecularresearch.Thisstudy
selectedIlluminaHiSeqiMtheplatformcarriedouthigh-throughputsequencingontheleavesandstemsofG.
formosana,andtheresearchclarifiedthatatotalof93975high-qualityunigeneswerespliced,withanN50of1
146bpandanaveragelengthof624.78bp;comparedwithsevenmajordatabasessuchasGOdatabase,56455
unigenesannotatedatleastonedatabasesuccessfully,and2005unigenesannotatedall.Atotalof3286unigenes
wereobtainedinthedifferentialexpressionofrootsintheleavesofG.formosana,ofwhich1852wereexpressed
withanupwardtrendand1434wereexpressedwithadownwardtrend.UsingtheKEGGdatabase,39unigenes
werefoundtobeinvolvedinflavonoidbiosynthesis,with11showingsignificantdifferences,distributedamong12
synthetases.Theseresultsprovideatheoreticalbasisforf
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