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生物信息学：药物靶点识别_（4）.分子对接与虚拟筛选.docx

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    分子对接与虚拟筛选

    分子对接的基本原理

    分子对接（MolecularDocking）是一种计算方法，用于预测小分子（如药物）与大分子（如蛋白质）之间的相互作用模式。通过分子对接，可以评估小分子与蛋白质结合的亲和力，从而筛选出具有潜在药效的化合物。分子对接的基本原理包括以下几个步骤：

    蛋白质结构准备：获取蛋白质的三维结构，通常来自蛋白质数据库（PDB）。

    活性位点识别：确定蛋白质的活性位点，即小分子可能结合的区域。

    小分子准备：获取小分子的结构，通常来自化学数据库或自行设计。

    对接算法：使用对接软件（如AutoDock,DOCK,GOLD等）进行分子

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