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?样本采集与实验流程解螺旋|知识金牌
解螺旋 | 陪伴医生科研成长知识金牌01微生物组研究实验流程02微生物组研究样本采集方法03常见问题CONTENTS课程目录
微生物组研究样本采集方法01
知识金牌微生物组研究样本采集口腔呼吸道皮肤消化道生殖道牙釉质舌腮上颚扁桃体牙龈肘窝上臂趾缝鼻腔咽部气管肺部人类/鼠类粪便鼠类肠道组织鼠类肠道内容物阴道解螺旋|陪伴医生科研成长子宫羊水
口腔样本取样 知识金牌解螺旋|陪伴医生科研成长取样前注意事项了解测试者的口腔病史,记录相应信息;抗生素对于菌群的影响较大,故要求受试者取样前3个月内未使用过抗生素;若有,请详细记录使用时间及抗生素种类;取样当天与平时相比,身体须无特殊不适症状;取样前1hr,请勿进食、饮水、吸烟或嚼口香糖,用饮用水将口腔内的杂物洗漱干净
口腔样本取样-唾液 知识金牌将唾液保持在口中持续至少1min,吐入灭菌离心管中,重复多次以收集唾液2-5mL(不含泡沫部分);液氮速冻,自封袋封存,-80℃保存,干冰寄送;或采用商业化唾液取样管取样解螺旋|陪伴医生科研成长
知识金牌舌背部:刮取舌中心1cm2的部位,约5s;上颚:刮取整个硬颚,约10s;颊粘膜:刮取左侧和右侧的整个口腔粘膜区,每侧约10s,避免接触到牙齿;角质化的牙龈:刮取颚前方的牙龈,约10s;腭扁桃体:分别刮取左侧和右侧的腭扁桃体5s;咽喉:慢慢地将拭子放入咽部后方,约5s,注意不要刮到扁桃体;(由于咽反射咽喉部位样本较难收集,建议取完别的部位后再取)龈上牙菌斑:记录牙菌斑取自哪颗牙齿,如臼齿,前臼齿,门牙。先干燥取样的部位,用棉拭子刮取尽可能多的牙菌斑;龈下牙菌斑:与龈上牙菌斑处理方式相同,需要注意要清除残留的龈上牙菌斑,并注意要丢弃有出血的样本取样后剪下棉拭子头(2-3个)放入灭菌冻存管,液氮速冻,-80℃保存,干冰寄送;注意:棉拭子可用无菌生理盐水或磷酸盐缓冲液润湿,以增加微生物附着率口腔样本取样-口腔组织解螺旋|陪伴医生科研成长
皮肤样本取样 知识金牌采样前注意事项了解测试者的皮肤病史,详细记录相应信息;抗生素菌群的影响较大,故要求受试者取样前3个月内未使用过抗生素;若有,请注明使用时间及种类;取样前7天,脸部,头皮,脖子,胳膊,前臂或者手未使用过抗生素或者萜类物质;取样前24hrs不能洗澡、不能使用润肤乳及抗菌活性的肥皂等,取样前7天未使用抗菌成分的沐浴用品取样方法将灭菌棉拭子在ST溶液(0.15MNaCl加有0.1%Tween20)或灭菌生理盐水中浸湿,在目标皮肤区域擦拭30s;取样后将棉拭子头(2-3个)剪下放入灭菌冻存管,液氮速冻,-80℃保存,干冰寄送Doi:10.1038/ismej.2012.81解螺旋|陪伴医生科研成长
呼吸道样本取样 知识金牌咽部棉拭子取样用灭菌棉拭子在受试者咽后壁旋转1周,注意在取样时避免触及舌、口颊黏膜和唾液鼻腔鼻咽拭子取样尽可能使明亮的光线照进鼻腔,将洁净的鼻咽拭子轻轻插入鼻道内鼻腭处,停留片刻后缓慢转动退出;拭子头浸入采样液中,尾部弃去气管镜防污染采样刷(PSB)取样口咽部麻醉后将支气管镜引入到受试者取样部位(声带,支气管等),PSB经气管镜刷检口插入刷取分泌物,气管镜取出后刷检分泌物送检,操作过程中避免负压吸引,放置气管镜管道污染肺泡灌洗液(BAL)取样口咽部麻醉后将支气管镜通过口或鼻引入到受试者取样部位(声带,支气管等),滴注50-150mL无菌生理盐水进行标本的抽取,灌洗液通过过滤或离心的方式富集;富集后的样品液氮速冻,-80℃保存,干冰寄送解螺旋|陪伴医生科研成长
生殖道样本取样 知识金牌解螺旋|陪伴医生科研成长取样前注意事项了解测试者妇科病史,详细记录相应信息(如pH值等),记录测试者12个月内避孕药的使用情况;采血进行HIV、HSV检查;在取样前6个月内不能使用抗生素、皮质类固醇、细胞激素、氨蝶呤或免疫抑制细胞毒性药物及抗生素为主要成份的食物、大剂量的益生菌产品(≥108cfu/天)、激素类阴道环等;女性测试者必须在非生理期取样;尿妊娠试验结果为阴性(除非研究目的如此);取样前七天未使用生殖道相关药物(包括抗真菌药物);取样前48hrs尽量避免使用加氯消毒的游泳池或浴盆,女性测试者避免性行为,避免使用避孕药、避孕隔膜、宫颈罩、避孕海绵、栓剂、女性喷雾剂等取样方法据实验研究需求,用灭菌棉拭子从目标区域采样;棉拭子擦拭5次后,将棉拭子头(2-3个)置入含有无菌磷酸盐缓冲液的冻存管
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