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;一、蛋白质的分子大小
二、蛋白质结构的组织层次
三、肽
四、蛋白质测序的策略
五、蛋白质测序的一些常用方法
六、根据基因的核苷酸序列推定多肽的氨基
七、蛋白质一级结构的举例
八、蛋白质序列数据库
九、肽与蛋白质的化学合成:固相肽的合成;一、蛋白质分子的大小;对简单蛋白质,用110除它的Mr即可约略估计其氨基酸残基的数目。
蛋白质中20种基本aa平均Mr约138,但多数蛋白质较小氨基酸占优势,平均Mr接近128。形成一个肽键将除去一分子H2O),所以氨基酸残基的平均Mr约为110;二、蛋白质结构的组织层次;(一)肽和肽键的结构
(二)肽的物理和化学性质
(三)天然存在的活性肽;(一)肽键的结构;短肽以偶极离子形式存在。pH0―14,亚氨基不解离,酸碱性取决于N端α-NH3+和C端α-COO-以及侧链R上可解离的基团。
α-羧基,α-氨基和侧链R基上的活性基团都能发生与游离氨基酸相似的反应。
凡有肽键结构的化合物都会发生双缩脲反应,可用于定量分析。双缩脲反应是肽和蛋白质特有的反应。
旋光性:一般短肽的旋光度等于其各个氨基酸的旋光度的总和;蛋白质水解得到的各种短肽,只要不发生消旋作用,也具有旋光性.;pI=1/2(4.5+7.8)=6.15;四、蛋白质测序的策略;一、蛋白质的分子大小
二、蛋白质结构的组织层次
三、肽
四、蛋白质测序的策略
五、蛋白质测序的一些常用方法
六、根据基因的核苷酸序列推定多肽的氨基
七、蛋白质一级结构的举例
八、蛋白质序列数据库
九、肽与蛋白质的化学合成:固相肽的合成;(一)末端分析;(二)二硫桥的断裂;(四)多肽链的部分裂解;(六)肽段在原多肽链中的次序决定;胰岛β细胞分泌,前胰岛素原→内质网腔酶切信号肽(N-端约20个残基)→胰岛素原→高尔基体酶切连接胰岛素B链C端和A链N端连接肽(C肽,约30个残基)→成熟胰岛素
1953,SangerF等首次完成了胰岛素的全部结构测定工作;九、肽与蛋白质的化学合成:固相肽的合成;Dicyclohexylcarbodiimide
(DCC);不溶性树脂;一、蛋白质分子的大小;一、蛋白质的分子大小
二、蛋白质结构的组织层次
三、肽
四、蛋白质测序的策略
五、蛋白质测序的一些常用方法
六、根据基因的???苷酸序列推定多肽的氨基
七、蛋白质一级结构的举例
八、蛋白质序列数据库
九、肽与蛋白质的化学合成:固相肽的合成;一、蛋白质的分子大小
二、蛋白质结构的组织层次
三、肽
四、蛋白质测序的策略
五、蛋白质测序的一些常用方法
六、根据基因的核苷酸序列推定多肽的氨基
七、蛋白质一级结构的举例
八、蛋白质序列数据库
九、肽与蛋白质的化学合成:固相肽的合成;肽:是由一个氨基酸的羧基和另一个氨基酸的氨基脱水缩合而成的化合物.
肽键:氨基酸间脱水后形成的共价键称肽键(酰氨键),氨基酸→氨基酸残基.
二肽:两个氨基酸,寡肽:2-10个氨基酸,多肽多于10个氨基酸.;(一)肽键的结构;先分别判断各解离基团带电情况,再统计净电荷的量;一、蛋白质的分子大小
二、蛋白质结构的组织层次
三、肽
四、蛋白质测序的策略
五、蛋白质测序的一些常用方法
六、根据基因的核苷酸序列推定多肽的氨基
七、蛋白质一级结构的举例
八、蛋白质序列数据库
九、肽与蛋白质的化学合成:固相肽的合成;;(一)末端分析
(二)二硫键的断裂
(三)氨基酸组成的分析
(四)多肽链的部分裂解
(五)肽段氨基酸序列的测定
(六)肽段在原多肽链中的次序的确定
(七)二硫键位置的确定
;2.羧基末端分析:
采用羧肽酶法;一般用酸水解:6mol/LHCl,110°10~24h,Trp破坏,Ser、Thr、Tyr也被破坏,程度与保温时间有线性关系;
辅之以碱水解:5mol/LNaOH,110°,20h;
氨基酸自动分析仪;
表示方法:一般用每摩尔蛋白质中所含的氨基酸残基的摩尔数表示.;苯胺基
噻唑啉酮;Partialproteindigestofsampleissmearedalongoneedgeofpaper;欧洲生物信息中心研究所和瑞士生物信息研究所共同管理的SWISS-PROT有10多万条肽链的信息;
美国国家生物医学基金会主持的PIR有近30万条肽链的信息,但多数由核酸信息翻译而来,有些未经严格检验。
美国政府支持的GenBank和欧洲的EMBL有大量的基因序列信息,从其阅读框可以得到蛋白质序列的不少信息。;Insolublepolystyrenebead;α-aminogroupofaminoacid1attacksactivatedcar
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