NY_T 2594-2016植物品种鉴定 DNA分子标记法 总则.pdf

ICS 65.020.01B 05NY中华人民共和国农业行业标准NY/T2594—2016代替NY/T2594—2014总则植物品种鉴定DNA分子标记法General guideline for identification of plant varieties using DNA markers2016-10-01实施2016-05-23发布中华人民共和国农业部发布 NY/T2594—2016目次前言范围12规范性引用文件3术语和定义标准编制的基本要求.1特定植物属（种）品种鉴定标准研制的具体技术要求56数据库构建的具体要求结果统计与判定，7附录A（规范性附录）植物品种鉴定DNA分子标记法标准的结构和主要技术内容1 NY/T2594—2016前言本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草本标准代替NY/T2594—2014《植物品种鉴定DNA指纹方法总则》。本标准与NY/T2594--2014相比.除编辑性修改外，主要技术变化如下：删除了“规范性引用文件”、“原理”；删除了“核心引物的筛选评估及等位变异的确定”、参照品种选择原则”“电泳检测”、“数据编码及处理”、PCR扩增反应”；“增加了插人缺失多态性”（见3.4）、位点”（见3.5）、扩展位点”（见3.7）和特异位点”（见3.8)4个术语，调整了核心引物”（见3.6）术语；增加了“标准编制的基本要求”（见4和附录A）；增加了扩展位点的选择”（见5.2.2）、特异位点的选择”（见5.2.3）；-增加了基因分型平台”（见5.5.2）、位点的使用”（见5.5.3）；一增加了数据库构建基本原则”（见6.1）；一增加了“位点统计”（见7.1）；调整了样品分析数量”（见5.3.2）；调整了判定方法”（见7.2）、结果表述”（见7.3）。本标准由中华人民共和国农业部种子管理局提出本标准由全国植物新品种测试标准化技术委员会（SAC/TC277）归口。本标准起草单位：农业部科技发展中心、北京市农林科学院玉米研究中心、全国农业技术推广服务中心。本标准主要起草人：王凤格、唐浩、邓超、周泽宇、韩瑞玺、易红梅、金石桥、张力科、赵久然、吕波、堵苑苑、田红丽。本标准的历次版本发布情况为：NY/T2594—2014。I NY/T2594—2016DNA分子标记法总则植物品种鉴定1范围本标准规定了植物品种鉴定DNA分子标记法标准研制的总体原则，进行鉴定的总体技术要求、主要技术内容以及技术标准的编制格式。本标准适用于植物品种鉴定DNA分子标记法技术标准的建立。在编制特定植物属（种）品种鉴定DNA分子标记法标准时，应遵循总则提出的原则和要求.同时结合该植物属（种）的特殊性，形成适合该植物属（种）品种鉴定DNA分子标记法的标准2规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件，仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件，其必威体育精装版版本（包括所有的修改单）适用于本文件。GB/T1.1标准化工作导则第1部分：标准的结构和编写3术语和定义下列术语和定义适用于本文件。3. 1DNA分子标记DNAmarker以个体间遗传物质核苷酸序列变异为基础的遗传标记，是DNA水平遗传多态性的直接反映3. 2简单重复序列simplesequencerepeat(SSR）基因组中由2个及以上核苷酸组成的基本单位重复多次构成的一段DNA序列。3.3单核苷酸多态性singlenucleotidepolymorphism(SNP）基因组中由单个核苷酸的变异引起的DNA序列多态性。3. 4插入缺失多态性insertion-deletionpolymorphism(IDP）基因组中由核苷酸插人或缺失引起的DNA序列多态性。3. 5位点locus染色体上一个基因或者标记的位置。3.6核心位点corelocusDNA分子标记法鉴定品种时优先选用的一组位点，具有多态性高、重复性好、分布均匀的特点，统一用于品种DNA分子标记数据采集和品种鉴定的位点。3. 7扩展位点extendedlocusDNA分子标记法鉴定品种时备选的一组位点，具有重复性好、分布均匀的特点。3. 81 NY/T2594—2016特异位点specificlocus针对某一特定品种DNA分子标记鉴定而提供的.除核心位点和扩展位点之外的能够将该品种与其他品种区分开的位点。3. 9参照样品referencesample代表核心位点主要等位变异的一组样品。用于辅助确定待测样品在某个位点上等位变异扩增片段的大小校正仪器设备的系统误差。4标准编制的基本要求4.1标准化对象的确定以植物属或种为基本单位分类制定。如果植物属内各个种之间的差异较小，则以整个属作为基本单位。反之.则应以各个种作为基本单位。特殊情况下，如果植物种内各亚种间的差异极为明显，可考虑以亚种作为基本