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新型冠状病毒起源及宿主分析 摘要：新型冠状病毒(2019-novel coronavirus,2019-nCoV )为一种高致病性的新毒株，通过通过spike刺突蛋白（2019-nCoV配体）连接到ACE2蛋白（细胞上的受体蛋白）而感染细胞，随后复制，破坏微环境，使人类患呼吸系统等疾病重则致死。本文以几种已存冠状病毒为研究对象利用生物信息学手段分析其同源性，并推测其起源[1]；以2019-nCoV受体ACE2为研究对象分析含有相似片段的物种以判断可能携带该病毒的可能性。 关键词：新型冠状病毒；疫情；宿主 2019-nCoV Origin and Host Analysis WANG Kai-yu Abstract: The new coronavirus (2019-novel coronavirus, 2019-nCoV) is a highly pathogenic new strain, which is connected to the ACE2 protein (receptor on the cell) through the spike spike protein (2019-nCoV ligand) Proteins) and then infect cells, then replicate, destroying the microenvironment, causing humans suffering from respiratory diseases and other deaths. This article uses several existing coronaviruses as research objects to analyze their homology using bioinformatics and speculate on their origin [1]; using 2019-nCoV receptor ACE2 as the research object to analyze species containing similar fragments to determine possible carrying The possibility of the virus. Keywords: new coronavirus; epidemic situation; host 引言 新型冠状病毒(2019-novel coronavirus,2019-nCoV )疫情爆发给世界带来了巨大的损失，对公共卫生构成了重大威胁。2019-nCoV是一种高致病性人类冠状病毒，该病毒为此前无记载的新毒株，人们对该病毒的高侵袭力了解甚少。人感染了冠状病毒后常见体征有呼吸道症状、发热、咳嗽、气促和呼吸困难等。在较严重病例中，感染可导致肺炎、严重急性呼吸综合征、肾衰竭，甚至死亡[2]。目前对于新型冠状病毒所致疾病没有特异治疗方法。但随着对该病毒的深入研究，已开发出了一些对新冠肺炎辅助治疗的药物，且抗2019-nCoV的疫苗也在临床试用阶段。但2019-nCoV的传播力及感染力极强，随时都有可能在某地爆发，研究已证实该病毒的感染方式为飞沫传播及接触传播。在人群中可通过戴口罩、勤洗手等方式降低传播几率，并已显示了良好的控制效果。但研究表明该病为人畜共患病，在最开始追溯2019-nCoV起源时有文献以穿山甲、蝙蝠、果子狸等野生动物[3]为对象将相关病毒序列比对并分析特定结构域，其结果显示了很大的相关性。此后，许多研究相继证明了该病毒宿主的广泛性如在雪貂、猫中具有有效的复制能力。2019-nCoV具有两个显著基因组特点（1）通过结构研究和生物化学研究，2019-nCoV与人受体ACE2亲和[4-6]；（2）2019-nCoV的刺突蛋白在S1-S2的边界线嵌合了12个核苷酸形成了多元切割位点[7]，此外预测有3个O连接的多糖在这个区域。6个受体结合域的氨基酸对结合ACE2受体具关键作用，并决定了SARS-CoV样特征（SARS-CoV：Y442；L472；N479；D480；T487和Y4911，SARS-CoV-2:L455，F486，Q493，S494，N501和Y505）。该病毒的感染机制为：通过spike刺突蛋白（2019-nCoV配体）连接到ACE2蛋白（细胞上的受体蛋白）[8]而感染细胞，随后复制，破坏微环境，使机体患病。在新冠病毒的核酸序列中，编码这个配体的区域叫做RBD（受体结合域），根据基因测序的结果，新冠病毒的RBD上结合ACE2的残基序列，和其他几种冠状病毒非常像。分别是（1）新冠病毒?；（2）蝙蝠RaTG13 病毒?；（3）穿山甲冠状病毒?；（4）SARS病毒?；（5）蝙蝠SAR