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SQUEEZE 程序使用方法的讨论 SQUEEZE：晶体结构精修中无序溶剂综合症的一剂良药 当前版本的SQUEEZE程序是针对一些小的片段结构而设计编写的，小的片段结构主要包括无序的溶剂分子，比如甲苯，二氯甲烷，四氢呋喃，水，甲醇等。阴离子也可以用相同方式来处理。但是，一定要注意电荷平衡的处理。 SQUEEZE程序嵌在Platon程序中，配合小片段结构晶体结构精修程序SHELXL-97程序使用。SQUEEZE相当于一个数据过滤器。输入文件包括.hkl 和.res 文件，.res文件中应该包括全套的精修参数，氢原子等，但不能包括任何代表无序部分的哑原子等。 在使用SQUEEZE的时候，一般在程序中输入CALC SQUEEZE，或者在pwt/wingx中的图形界面（Graphical menu）点击SQUEEZE。 结果文件包括两个，一个是.lis文件，列出了计算过程的细节；另一个是.hkp文件，除去了那些无序结构溶剂片段的衍射数据贡献，只保留了有序的结构部分对应的衍射数据。 为了精修剔除了讨厌的无序溶剂分子的Fo2 数据，需要将.hkp文件的扩展名改为.hkl。如果想得到.FCF文件，可以运行Platon里面的CALC FCF菜单。 精修程序给出新的权重值，同时也给出新的R值。Platon网站给出了相应的实例。 注意事项： 1. SHELXL-TWIN指令目前尚不能能使用; 2. 溶剂分子对结构因子的贡献被处理为error-free。也就是说无溶剂的Fo2保留原来的偏差 3. 待处理数据应具有合理的分辨率（比如说Mo靶映保证25°） 4．已知部分应该已经全部合理的加氢 5．晶胞中的空隙不应该超过26个 6．SQUEEZED处理的溶剂分子不能超过晶胞体积的30%。 具体的一些操作： （1）在准备用SQUEEZE前，要删除掉那些不确定的溶剂分子，这里需要注意的是，有一种观点认为应该把所有溶剂分子删除掉，还有一种观点是只删除掉那些无序的分子，从官方给的资料无法得到答案。但后一种观点似乎更合理； （2）除了修改res外，还要注意修改ins，但由于目前大家大都使用xhsell，只需在界面中删除那些无序溶剂分子就可以了； （3）得到的.hkp文件需要改成.hkl文件，这时不需要再从XPREP开始解析，接着原来的过程解析就可以了； （4）在SQUEEZE后，有时会出现怪异的q峰； （5）处理过的数据，R因子将更低，GOOF值也更合理。 1。 SQUEEZE 我理解是用做好的主体分子为依据，反向对 HKL 衍射数据进行“修改”(refine), 以剔除高度无序的溶剂分子得到所谓无溶剂分子（solvent-free) 的HKL 文件。 2。 实际使用中，要用PLATON计算出的电子数和空腔体积来确定溶剂分子的种类和数目，不太容易（个人观点）。 3。 用SQUEEZE 处理过的数据是可以发表的。 我对必威体育精装版版的SQUEEZE 有点疑问。刚刚修一个porous的结构，我怎么修R1都在0.13左右（squeeze过的结果），师兄一修R1直接就到0.08了。我百思不得其解，最后没办法了，把platon更新了一下，再以原始的hkl来squeeze了一下，R1直接就降到0.07了，但是同时GOOF也变成0.75了。把weight改成推荐的值，GOOF也还是小于0.8。当然可以通过手动改weight把GOOF调回1。但是我对squeeze一直有所戒备，这次的必威体育精装版版的squeeze又如此强大，我不知道这样的结果可信度有多高。