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聚丙烯酰胺凝胶电泳 聚丙烯酰胺凝胶电泳适宜分离鉴定低分子量的蛋白质,小于1kb的DNA片段和DNA序列。分析装载的样品容量大,可回收,DNA纯度高。在催化剂TEMED(N-N-N,- N,-四甲基乙二胺)和过硫酸胺的作用下,丙烯酰胺聚合成长链,聚丙烯酰胺链在交联剂,N- N,-亚甲双丙烯酰胺的参与下,聚丙烯酰胺链与链之间交叉联结形成凝胶。 1.1 配制30%丙烯酰胺:丙烯酰胺29g N- N,-亚甲双丙烯酰胺 1g 加水至100ML,40 1.2 配制5×TBE缓冲液:TRIS碱 54克 硼酸 27.5克 EDTA 3.72克 加水至1L 1.3 制备聚丙烯酰胺凝胶所用试剂体积 试剂 制备不同浓度(%)凝胶所用试剂体积(ml) 3.5 5.0 8.0 12.0 20.0 30%丙烯酰胺 11.6 16.6 26.6 40.0 66.6 水 67.7 62.7 52.7 39.3 12.7 5×TBE 20.0 20.0 20.0 20.0 20.0 10%过硫酸铵 0.7 0.7 0.7 0.7 0.7 1.4 DNA在聚丙烯酰胺凝胶中有效分离范围 丙烯酰胺(%) 有效分离范围(bp) 二甲苯氰FF 溴酚蓝 3.5 1000-2000 460 100 5.0 80-500 260 65 8.0 60-400 160 45 12.0 40-200 70 20 15.0 25-150 60 15 20.0 6-100 45 12 聚丙烯酰胺凝胶电泳具体步骤 2.1从NaOH池中捞出浸泡的玻璃板,取出上面的残胶 2.2 把玻璃板拿到流动水处洗刷干净 2.3 洗干净的玻璃板至于玻璃板架上晾干 2.4 用乙醇擦洗玻璃板 2.5 带凹口的背板涂上硅化剂,面板则涂上粘合剂,防止电泳完毕发生撕胶和脱胶的可能(涂摸要均匀) 2.6 面板在下,背板在上。两侧用塑料板密封,并用夹子夹好。底部调节使之水平 2.7 将加入催化剂后的凝胶沿凹口均匀倒下,插入适当的封条。勿使封条下留下气泡。用夹子夹紧封条部位 2.8 室温聚合30分钟,小心取出凹口处封条,用水冲洗加样孔(否则封条所残留的丙烯酰胺在加样孔聚合产生不规则表面,引起DNA带变形) 2.9 将凝胶固定在电泳槽里。带凹口背板朝里,面向缓冲液槽 2.10 用0. 5×TBE灌满电泳槽的缓冲液槽,接上电极,打开电源。调试工作环境为电压2000-2200V,电流150-200mA,单板电泳功率为80W。预热30分钟左右。 2.11 点样之前需切断电源,用枪将点样孔的气泡及胶吹出,然后插入点样梳,注意不要插得太深,否则点样胶面会变形,影响美观及点样。 2.12枪吸加样品,PCR产物先加loading buffer 10ul ,再变性5分钟左右,接着在冰水中冷却5分钟以上方可点样,点样完毕,电泳开始。 2.13 电泳至所需位置后,切断电源,拔出导线,回收缓冲液,卸下玻璃板。在工作台上,将背板撬起,放回原处。将面板进行银染 3. 电泳后的银染检测 3.1 原理:影像产生是由于核酸在胶上所占部位与周围的氧化——还原势不同而产生。银染液中的银离子(Ag+)可与核酸形成稳定的复合物,然后用还原剂如甲醛使Ag+还原成银颗粒,这样核酸电泳带就染成了黑褐色。 3.2 银染 银染液的配制:称2.5至3.0g AgNO3l水 银染:将电泳完的面板首先在银染漂洗盆了漂洗赶紧,使胶面上没有异物。玻璃板反面没有污染物。 将加入银染液的银染盆放在摇床上后,将面板放入银染1小时左右。 3.3 显影 显影液的配制:NaOH20g, Na2CO30.6g,甲醛4.5ml,加水1200ml 显影:将面板从银染盆里取出,在银染漂洗盆里漂洗,震荡5-6次,取出后使其表面尽量无水,再放入已加入显影液的显影盆里(显影,显影液的配制及甲醛的加入都需要在通风橱的摇床上进行)显影过程大约10到15分钟,以DNA条带清晰可见为准。 将显现完毕的板子在显影漂洗盆里漂洗后,方可读带。 本实验室凝胶电泳相关常用试剂配方: 我实验室常用的聚丙烯酰胺凝胶是6%变性聚丙烯酰胺凝胶(简称变性胶,PAGE),就是在普通聚丙烯酰胺凝胶中加入变性剂。我们使用的变性剂是尿素。 6%PAGE具体配制方法为: 尿素210g,10×TBE 25ml ,丙烯酰胺28.5 g ,亚甲双丙烯酰胺 1.5g,加水定容至500ml,过滤后使用。 考虑到方便使用的问题,一般一次配制2L(尿素840
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