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第一章生物分子导论PPT

生 物 化 学;教材:王镜岩、朱圣庚、徐长法主编, 《生物化学教程》。 高教出版社,2008.6。 ;生物化学是生命的化学,是研究生物体的化学组成(生物分子)和生命活动过程中的化学变化的一门科学。 ;一、生物化学主要涉及以下几个方面的内容 ;二、本课程的结构、重点与难点 ;第二部分:物质代谢及其调节。 包括代谢总论(第17章);生物能学(第18章);糖代谢(第19-24章);脂类代谢(第25章);氨基酸代谢(第26、27章);核苷酸代谢(第28章)。 重点:生物体内ATP的产生;糖代谢;脂类代谢;物质代谢调节。 难点:生物氧化还原反应中自由能变化;电子传递与氧化磷酸化;三羧酸循环(柠檬酸循环);脂肪酸的生物合成;核苷酸的生物合成;第一篇 生物分子的 结构和化学 ;第一章 生物分子导论;活生物的共同特征或生命属性: 化学成分一致性 严整有序的结构 新陈代谢 自我复制的能力;一、生命物质的化学组成 (一) 生命元素 30种活生物所必需的生命元素。H (49%),O (25%),C(25%),N(0.27%), P, S, Ca, Mg, Na, Cl 微量(痕量)元素:Mn,Fe, Co, Cu,Zn (二)生物分子 1.生物分子是碳的化合物 2.生物大分子及其构件 ;二、 生物分子的三维结构 (一)生物分子的大小 (二)立体异构与构型 立体异构:具有相同的结构式,但是价键的三维空间的关系不同的异构体。(立体模型、透视式或投影式) 构型:规定立体异构体中价键在空间的相对取向。故构型的立体化学特点是如果没有共价键的断裂和重新形成,立体异构是不会发生的。(注意与构象相区别) ; 依据构型或立体异构体的产生可分为: 1、几何或顺反异构体:是由于分子中双键或环的存在,限制了取代原子或板子基团绕键轴的自由旋转,这样产生的产体异构体。顺反异构体一般不具有旋光性. 2、旋光或光学异构体:是由于某种原因手性中心的存在,绕手性中心的取代基团以特定的顺序排列,这样形成的产体异构体。旋光异构体一般都具有旋光性。(注意对映体与非对映体的区别) ;旋光性 普通光: 有各不同方向振动的光波。 尼可尔棱镜:只有与镜轴平行的光才可通???。 偏振光:(通过尼可尔棱镜的光)仅在某一平面上振动的光叫偏振光。 旋光仪:检查偏振光的仪器。 旋光活性物质:可使偏振光旋转的物质称为旋光活性物质。 旋光度:使偏振光振动平面旋转的角度为旋光度。用“α”表示。 右旋:使偏振光振动平面向右旋转称为右旋。用“+”表示。 左旋:使偏振光振动平面向左旋转称为左旋。用“-”表示。 旋光度:与溶液浓度、盛液管的长度、温度、光波的波长以及溶剂的性质有关。 比旋光度:含有1g溶质的1ml溶液放在长1dm的盛液管中测出的旋光度。 [α]tλ=α/c×l [α]tλ:比旋光度 t:测定温度 λ:入射波长, α:旋光度, c:溶液浓度(g·ml-1), l:盛液管长度(dm) 例如:[α]20D=+3.8°表示在20℃时用钠光灯源,某物质的比旋光度为右旋3.8°;手性中心:不对称碳原子或手性碳原子,具有4个不同取代基团的碳原子,一般含有n个手性碳原子的化合物,有2n个旋光异构体。 DL命名系统: ;R、S命名系统 规则:把手性碳原子上四个基团中最小的基团放于离观测者最远的位置,来观察其他三个基团的顺序,若按顺序规则,三者的排列从最优基团到次优基团,到最小基团,若为顺时针,则其构型用R表示;反之,用S表示。 优先性:-SH-OR-OH-NH2-COOHCONH2CHO-CH2OH C6H5CH3-H;(三) 生物分子间相互作用的立体专一性 立体专一性:区分立体异构体的能力。 外消旋物:D、L两种手性形式等摩尔混合物存在。 (四)构象与三维结构 构象描述有机分子的动态立体化学,反映有机分子中原子或原子基团在空间里的实际排列,因而有时将构象看作是三维结构的同义词。 构象:由于分子中单键自由旋转以及键角有一定的柔性,具有同一结构式和同一构型的分子在空间中可有多种形态,这些形态称为构象。(不需要共价键的破坏即可性转变);生物分子构象的立体化学可用 1、X-射线衍射(晶体结构) 2、NMR(溶液结构) (五)本维结构的分子模型 1、透视式; 2、骨架式; 3、球棍模型; 4、空间填充模型。;三、 生物结构中的非共价力 分子内一般由共价键连在一起,分子间的力是非共价的,在生物大分子内的相邻基团之间也存在许多非共价力,它是稳定生物大分子三维结构的作用力,生物分子主要是通过非共价力的彼此影响,以行使功能的。 个别的非共价力是微

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